More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1369 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  92.78 
 
 		 526 aa  914    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  92.97 
 
 		 526 aa  889    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  99.24 
 
 		 526 aa  1018    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  94.68 
 
 		 526 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  95.63 
 
 		 526 aa  929    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  99.24 
 
 		 526 aa  1018    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 526 aa  1023    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  63.14 
 
 		 528 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  46.9 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  42.5 
 
 		 526 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  42.02 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  42.02 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  42.02 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  42.02 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  42.02 
 
 		 526 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  42.02 
 
 		 526 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  43.05 
 
 		 528 aa  349  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  41.33 
 
 		 526 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  42.45 
 
 		 527 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  42.05 
 
 		 527 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  42.08 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  41.81 
 
 		 538 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  41.06 
 
 		 527 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  42.53 
 
 		 527 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  42.34 
 
 		 527 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  42.34 
 
 		 527 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  42.96 
 
 		 531 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  43.95 
 
 		 531 aa  323  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  39.06 
 
 		 526 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  37.62 
 
 		 524 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  38.87 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  34.9 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  34.16 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  36.47 
 
 		 533 aa  260  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  32.68 
 
 		 534 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  38.62 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 537 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  34.24 
 
 		 537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  36.02 
 
 		 535 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  34.01 
 
 		 537 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  37 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 		 525 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  35.86 
 
 		 521 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  35.75 
 
 		 550 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  36.4 
 
 		 553 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  35.38 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  35.45 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  33.9 
 
 		 535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.79 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  32.82 
 
 		 533 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  30.64 
 
 		 527 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  32.09 
 
 		 524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 		 556 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  36.31 
 
 		 539 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  34.02 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.69 
 
 		 532 aa  209  9e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.69 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.93 
 
 		 527 aa  207  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 524 aa  206  8e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  31.58 
 
 		 624 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 525 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  34.46 
 
 		 536 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  35.05 
 
 		 521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 		 524 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  35.36 
 
 		 552 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  32.16 
 
 		 624 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  35.6 
 
 		 525 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  35.6 
 
 		 525 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  36.09 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  35.23 
 
 		 488 aa  194  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  37.38 
 
 		 527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  37.52 
 
 		 533 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  37.33 
 
 		 533 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  37.33 
 
 		 533 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  30.23 
 
 		 549 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  31.82 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.11 
 
 		 571 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 		 624 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  31.78 
 
 		 621 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  33.59 
 
 		 535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  33.14 
 
 		 514 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.49 
 
 		 527 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  29.54 
 
 		 563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  29.54 
 
 		 563 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  29.54 
 
 		 563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  29.54 
 
 		 563 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  31.55 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  29.54 
 
 		 548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.79 
 
 		 566 aa  173  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 		 829 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.27 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  31.03 
 
 		 546 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  29.67 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  33.2 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  33.2 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 520 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  34.6 
 
 		 623 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>