More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3676 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 527 aa  1027    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  80.65 
 
 		 526 aa  818    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  67.94 
 
 		 531 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  80.65 
 
 		 526 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  93.17 
 
 		 527 aa  899    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  71.64 
 
 		 528 aa  710    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  81.78 
 
 		 526 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  94.12 
 
 		 527 aa  888    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  87.67 
 
 		 527 aa  872    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  80.46 
 
 		 526 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  99.05 
 
 		 527 aa  1020    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  94.12 
 
 		 527 aa  888    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  80.46 
 
 		 526 aa  816    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  94.31 
 
 		 527 aa  889    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  80.65 
 
 		 526 aa  818    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  80.65 
 
 		 526 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  80.65 
 
 		 526 aa  818    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  54.91 
 
 		 526 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  54.84 
 
 		 526 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  49.43 
 
 		 538 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  50.8 
 
 		 534 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  49.8 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  49.53 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  43.21 
 
 		 526 aa  360  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  42.91 
 
 		 526 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  43.21 
 
 		 526 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  41.25 
 
 		 528 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 		 526 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 		 526 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 		 526 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  42.45 
 
 		 526 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  39.13 
 
 		 535 aa  286  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  34.1 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  38.72 
 
 		 553 aa  266  8.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  36.57 
 
 		 550 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  38.68 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  34.24 
 
 		 525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.62 
 
 		 531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  37.81 
 
 		 550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  36.87 
 
 		 531 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  34.04 
 
 		 533 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  38.18 
 
 		 537 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.19 
 
 		 537 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  37.25 
 
 		 539 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 		 533 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  32.43 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  35.11 
 
 		 425 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  35.01 
 
 		 525 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  36.24 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 		 524 aa  226  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 524 aa  226  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 		 533 aa  226  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  35.99 
 
 		 624 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.46 
 
 		 624 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  33.6 
 
 		 521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  35.64 
 
 		 624 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  37.43 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  37.43 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 555 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  33.98 
 
 		 555 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 		 521 aa  213  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  36.83 
 
 		 533 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  35.31 
 
 		 621 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.39 
 
 		 527 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 		 555 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  35.1 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 633 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 555 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 555 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  33.87 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.22 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  37.13 
 
 		 623 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  31.27 
 
 		 524 aa  207  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  34.73 
 
 		 554 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.04 
 
 		 532 aa  207  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.4 
 
 		 551 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  33.93 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  33.54 
 
 		 549 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  33 
 
 		 581 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.31 
 
 		 527 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  30.31 
 
 		 527 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 		 519 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  30.58 
 
 		 536 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  32.55 
 
 		 545 aa  200  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 423 aa  200  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 		 631 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  32.69 
 
 		 566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  32.4 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  33.2 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  32.34 
 
 		 654 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 547 aa  190  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  33.95 
 
 		 566 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  33.65 
 
 		 626 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>