More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7391 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  86.56 
 
 		 521 aa  840    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 521 aa  993    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  65.08 
 
 		 525 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  64.89 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  64.38 
 
 		 525 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  62.81 
 
 		 511 aa  528  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  50.55 
 
 		 556 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  44.47 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3170  Sodium/hydrogen exchanger  51.25 
 
 		 542 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3361  sodium/hydrogen exchanger  51.06 
 
 		 543 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3287  sodium/hydrogen exchanger  51.45 
 
 		 542 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  41.9 
 
 		 514 aa  296  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3364  sodium/hydrogen exchanger  42.56 
 
 		 514 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.245657  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  39.46 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  33.85 
 
 		 531 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 526 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 526 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 526 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 526 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 526 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 526 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 526 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  39.49 
 
 		 534 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.92 
 
 		 526 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.14 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 		 526 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  34.92 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  36.72 
 
 		 531 aa  236  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 		 528 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  34.67 
 
 		 538 aa  236  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  35.21 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  34.35 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  35.41 
 
 		 553 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  35.63 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  35.62 
 
 		 528 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  37.12 
 
 		 531 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  35.69 
 
 		 537 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  35.22 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  36.29 
 
 		 526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  34.91 
 
 		 527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  34.15 
 
 		 527 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  31.2 
 
 		 527 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  33.71 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  33.71 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  33.71 
 
 		 527 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  31.69 
 
 		 537 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  33.69 
 
 		 533 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  30.8 
 
 		 524 aa  206  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  30.69 
 
 		 524 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  34.67 
 
 		 526 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.64 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  34.67 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  30.89 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 524 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  33 
 
 		 527 aa  196  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  35.58 
 
 		 624 aa  194  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  34.56 
 
 		 624 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.64 
 
 		 550 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  30.08 
 
 		 537 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  31.56 
 
 		 535 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  35.36 
 
 		 624 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  34.39 
 
 		 539 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  31.1 
 
 		 550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  38.33 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  38.33 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  38.33 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  34.18 
 
 		 623 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 		 621 aa  170  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 		 551 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  32.52 
 
 		 533 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  30.4 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.27 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 553 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  29.76 
 
 		 548 aa  163  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 		 563 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 		 523 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  27.97 
 
 		 548 aa  160  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  29.94 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  29.94 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  29.94 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  27.97 
 
 		 548 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4485  Na+/H+ antiporter  35.29 
 
 		 534 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0101363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>