More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3043 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  87.57 
 
 
523 aa  803    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
523 aa  1016    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4485  Na+/H+ antiporter  60.98 
 
 
534 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0101363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  31.58 
 
 
531 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  39.76 
 
 
535 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  31.31 
 
 
533 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.01 
 
 
537 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  39.76 
 
 
535 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  39.76 
 
 
535 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  32.89 
 
 
534 aa  240  5e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  34.21 
 
 
425 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  30.26 
 
 
533 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.26 
 
 
536 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  31.09 
 
 
524 aa  229  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  35.92 
 
 
537 aa  226  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.76 
 
 
532 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.34 
 
 
553 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.98 
 
 
524 aa  217  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 
532 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  34.86 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  30.8 
 
 
527 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.37 
 
 
525 aa  212  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  35.18 
 
 
533 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  35.18 
 
 
533 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
526 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
526 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
526 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
526 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
526 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
526 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  33.92 
 
 
526 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  30.47 
 
 
524 aa  210  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.22 
 
 
537 aa  210  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 
527 aa  209  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  34.98 
 
 
533 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  35.05 
 
 
423 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  32.93 
 
 
521 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  34.44 
 
 
526 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 
556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  33.47 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  34.03 
 
 
621 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.69 
 
 
535 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  35.61 
 
 
531 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  30.96 
 
 
537 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  30.15 
 
 
533 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  33.52 
 
 
526 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 
555 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 
550 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 
555 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 
624 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  28.96 
 
 
555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  36.87 
 
 
539 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 
555 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 
555 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  32.37 
 
 
535 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  26.74 
 
 
548 aa  190  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  26.93 
 
 
548 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.78 
 
 
551 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  30.3 
 
 
633 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  33.59 
 
 
624 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  32.89 
 
 
527 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 
524 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  30.41 
 
 
548 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  35 
 
 
624 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  28.92 
 
 
654 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  30.99 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 
521 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  27.68 
 
 
551 aa  183  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  32.07 
 
 
526 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  32.49 
 
 
531 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  27.89 
 
 
563 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  27.89 
 
 
563 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  27.89 
 
 
563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  27.89 
 
 
548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  30.65 
 
 
528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  27.89 
 
 
563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  30.1 
 
 
631 aa  181  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 
550 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  31.15 
 
 
549 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.38 
 
 
566 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  29.53 
 
 
547 aa  177  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  29.32 
 
 
548 aa  177  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  28.7 
 
 
554 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  30.04 
 
 
566 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  33.13 
 
 
488 aa  176  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  28.11 
 
 
555 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  33.84 
 
 
527 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  33.84 
 
 
527 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  30.33 
 
 
566 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 
577 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  28.11 
 
 
555 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  28.11 
 
 
585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  27.05 
 
 
549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 
538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  33.84 
 
 
527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  33.4 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  30.38 
 
 
571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  32.76 
 
 
527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>