More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0871 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 511 aa  967    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  66.54 
 
 		 525 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  67.24 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  67.24 
 
 		 525 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  62.55 
 
 		 521 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  62.81 
 
 		 521 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  46.34 
 
 		 556 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  45.45 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  42.97 
 
 		 514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3170  Sodium/hydrogen exchanger  49.03 
 
 		 542 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3364  sodium/hydrogen exchanger  42.38 
 
 		 514 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.245657  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3361  sodium/hydrogen exchanger  48.17 
 
 		 543 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  39.88 
 
 		 513 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3287  sodium/hydrogen exchanger  49.57 
 
 		 542 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  36.8 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  36.8 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  36.8 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  36.8 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  36.8 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  36.8 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  36.8 
 
 		 526 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  41.05 
 
 		 534 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  37.33 
 
 		 531 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  36.72 
 
 		 526 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  37.62 
 
 		 553 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  37.38 
 
 		 527 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  35.45 
 
 		 538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.92 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  37.1 
 
 		 526 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  37.48 
 
 		 531 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 527 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  35.86 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 		 526 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  35.64 
 
 		 537 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  36.02 
 
 		 527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 527 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  34.33 
 
 		 524 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  36.92 
 
 		 526 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  36.94 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  34.56 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.77 
 
 		 536 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 526 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  36.03 
 
 		 527 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  36.03 
 
 		 527 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  35.84 
 
 		 527 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.12 
 
 		 528 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 		 526 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  31.22 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  32.5 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  32.31 
 
 		 533 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.75 
 
 		 524 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  30.08 
 
 		 533 aa  219  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.69 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  34.93 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  35.04 
 
 		 527 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 		 524 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  31.2 
 
 		 527 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  32.68 
 
 		 524 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  34.39 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.25 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.26 
 
 		 537 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  35.15 
 
 		 552 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 		 532 aa  200  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  35.39 
 
 		 624 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  33.66 
 
 		 624 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  35.17 
 
 		 624 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  32.42 
 
 		 621 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31 
 
 		 535 aa  190  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  35.48 
 
 		 623 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  37.6 
 
 		 533 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  37.6 
 
 		 533 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  37.88 
 
 		 533 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  31.07 
 
 		 571 aa  176  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  31.5 
 
 		 535 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  36.25 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3597  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3670  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3602  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.69451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  30.64 
 
 		 423 aa  170  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  31.65 
 
 		 550 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0305  sodium/hydrogen exchanger  30.24 
 
 		 564 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0103  Na+/H+ antiporter  36.04 
 
 		 535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0112  Na+/H+ antiporter  36.04 
 
 		 535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  31.88 
 
 		 527 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  34.57 
 
 		 626 aa  163  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  36.21 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  33.88 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  33.81 
 
 		 523 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  31 
 
 		 539 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  28.92 
 
 		 581 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  29.78 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 829 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  30.38 
 
 		 549 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>