More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3361 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3199  sodium/hydrogen exchanger  74.72 
 
 
556 aa  642    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3170  Sodium/hydrogen exchanger  91.36 
 
 
542 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3287  sodium/hydrogen exchanger  98.16 
 
 
542 aa  739    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3361  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
543 aa  1017    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  52.08 
 
 
521 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  51.76 
 
 
521 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  48.58 
 
 
511 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  48.69 
 
 
525 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  48.41 
 
 
525 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  48.22 
 
 
525 aa  363  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  42.99 
 
 
519 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  35.07 
 
 
531 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3106  sodium/hydrogen exchanger  40.75 
 
 
514 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.493565  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  39.5 
 
 
534 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3364  sodium/hydrogen exchanger  40.84 
 
 
514 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.245657  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  39.58 
 
 
531 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  37.8 
 
 
513 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  38.1 
 
 
526 aa  264  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  37.78 
 
 
531 aa  261  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  37.41 
 
 
526 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 
533 aa  250  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  34.74 
 
 
538 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  33.77 
 
 
533 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
526 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
526 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
526 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
526 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
526 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
526 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  36.67 
 
 
526 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  34.87 
 
 
526 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  30.19 
 
 
537 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  36.99 
 
 
526 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.21 
 
 
534 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 
526 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  36.51 
 
 
526 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  37.16 
 
 
537 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.82 
 
 
526 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 
526 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  33.71 
 
 
536 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 
425 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  33.64 
 
 
528 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.39 
 
 
524 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  34.57 
 
 
526 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.71 
 
 
553 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 
532 aa  226  9e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  34.62 
 
 
531 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.39 
 
 
532 aa  223  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  34.7 
 
 
526 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.91 
 
 
528 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  31.42 
 
 
533 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  34.75 
 
 
527 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  29.66 
 
 
527 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  31.33 
 
 
525 aa  218  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 
535 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 
527 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.51 
 
 
524 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  29.41 
 
 
537 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
527 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 
527 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.61 
 
 
537 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 
423 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  31.3 
 
 
524 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  33.58 
 
 
527 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  32.46 
 
 
527 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  32.28 
 
 
527 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  32.28 
 
 
527 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0492  Na+/H+ antiporter  34.13 
 
 
533 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0986789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  33.09 
 
 
550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  30.85 
 
 
535 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  34.64 
 
 
552 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  35.21 
 
 
624 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  28.6 
 
 
524 aa  190  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18810  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  32.16 
 
 
571 aa  190  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.194584  normal  0.214728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  34.15 
 
 
624 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  26.76 
 
 
524 aa  186  9e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  37.66 
 
 
533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  37.66 
 
 
533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  37.66 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  33.57 
 
 
550 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 
624 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
551 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  33.46 
 
 
527 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  33.75 
 
 
621 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  33.08 
 
 
539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  32.57 
 
 
523 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3043  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 
523 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00823148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  32.2 
 
 
581 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 
553 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.45 
 
 
551 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4485  Na+/H+ antiporter  37.25 
 
 
534 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0101363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0510  Na+/H+ antiporter  31.71 
 
 
623 aa  167  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1111  sodium/hydrogen exchanger  34.73 
 
 
556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179355  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0093  Na+/H+ antiporter  38.31 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4047  sodium/hydrogen exchanger  32.45 
 
 
488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.23 
 
 
555 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  37.03 
 
 
527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  29.54 
 
 
555 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  32.7 
 
 
654 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 
555 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>