298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1569 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  100 
 
 
698 aa  1420    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  38.3 
 
 
705 aa  483  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  31.22 
 
 
666 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  28.86 
 
 
667 aa  274  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
692 aa  272  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 
692 aa  272  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  35.08 
 
 
581 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  35.21 
 
 
553 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  32.4 
 
 
563 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  32.24 
 
 
551 aa  250  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  32.4 
 
 
563 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 
563 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 
563 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  32.06 
 
 
548 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  31.52 
 
 
555 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  28.61 
 
 
679 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.06 
 
 
551 aa  244  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 
666 aa  241  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  32.4 
 
 
548 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  33.57 
 
 
545 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  31.36 
 
 
549 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  238  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  238  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  238  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  31.36 
 
 
549 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  238  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 
555 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  238  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  238  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  31.73 
 
 
633 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  32.31 
 
 
555 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 
549 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  32.59 
 
 
548 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  35.61 
 
 
548 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  31.34 
 
 
555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  31.51 
 
 
555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  33.09 
 
 
549 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  38.76 
 
 
547 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 
577 aa  232  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  31.95 
 
 
548 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  32.21 
 
 
566 aa  231  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 
549 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  36.62 
 
 
554 aa  230  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  32.04 
 
 
566 aa  230  7e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  27.17 
 
 
680 aa  230  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  27.17 
 
 
680 aa  230  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  38.24 
 
 
566 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  38.24 
 
 
548 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  39.6 
 
 
542 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  34.6 
 
 
543 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 
546 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  35.1 
 
 
770 aa  226  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  26.55 
 
 
757 aa  224  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  32.57 
 
 
631 aa  225  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  31.94 
 
 
654 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  30.66 
 
 
552 aa  219  8.999999999999998e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  39.74 
 
 
545 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  36.45 
 
 
546 aa  217  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  30.91 
 
 
560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.7 
 
 
577 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  30.58 
 
 
548 aa  214  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 
585 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 
555 aa  210  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 
555 aa  210  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 
549 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  29 
 
 
548 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.95 
 
 
690 aa  206  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 
537 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  35.75 
 
 
548 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  40.14 
 
 
545 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.42 
 
 
524 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.6 
 
 
524 aa  200  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  26.56 
 
 
534 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 
531 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.16 
 
 
537 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 
653 aa  194  6e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.63 
 
 
527 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  32.35 
 
 
537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0497  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.49 
 
 
695 aa  191  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  28.41 
 
 
527 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  31.63 
 
 
525 aa  189  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  28.79 
 
 
537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.52 
 
 
524 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11700  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  36.79 
 
 
775 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.273812 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.88 
 
 
688 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  30.81 
 
 
533 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  30.31 
 
 
533 aa  171  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  28.01 
 
 
524 aa  169  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.48 
 
 
536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  28.86 
 
 
534 aa  164  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  25.21 
 
 
689 aa  159  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  27.54 
 
 
535 aa  157  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 
526 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  25.41 
 
 
532 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 
425 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0429  Na+/H+ antiporter  24.96 
 
 
680 aa  154  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.708351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  25.41 
 
 
532 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  27.91 
 
 
535 aa  150  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>