273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11700 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11700  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  100 
 
 		 775 aa  1562    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.273812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  51.18 
 
 		 667 aa  303  6.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  53.05 
 
 		 666 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  50.28 
 
 		 770 aa  299  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  50.6 
 
 		 666 aa  293  9e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 		 757 aa  288  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  45.45 
 
 		 690 aa  260  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  37.98 
 
 		 581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  37.98 
 
 		 553 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  37.16 
 
 		 698 aa  206  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  39.23 
 
 		 551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  39.94 
 
 		 551 aa  201  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  36.99 
 
 		 654 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  40.46 
 
 		 554 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 		 692 aa  198  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 		 692 aa  198  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  36.31 
 
 		 555 aa  195  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  36.6 
 
 		 555 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  36.56 
 
 		 555 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  36.02 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  36.31 
 
 		 555 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  36.02 
 
 		 555 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  40.8 
 
 		 548 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  39.6 
 
 		 548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  39.31 
 
 		 566 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  34.44 
 
 		 679 aa  183  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  37.36 
 
 		 631 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  40.79 
 
 		 543 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  38.62 
 
 		 547 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  34.77 
 
 		 680 aa  181  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  34.77 
 
 		 680 aa  181  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  36.68 
 
 		 585 aa  180  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  36.68 
 
 		 555 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  36.68 
 
 		 555 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  34.42 
 
 		 688 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  35.59 
 
 		 566 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 566 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  38.89 
 
 		 563 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  38.89 
 
 		 563 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  38.56 
 
 		 563 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  38.56 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  38.56 
 
 		 563 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0429  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 680 aa  172  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.708351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  35.08 
 
 		 545 aa  172  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  34.05 
 
 		 689 aa  170  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  32.04 
 
 		 705 aa  169  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  36.12 
 
 		 546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  39.6 
 
 		 548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  35.65 
 
 		 577 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 548 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  36.15 
 
 		 548 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  39.42 
 
 		 542 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  37.54 
 
 		 549 aa  157  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  37.54 
 
 		 549 aa  157  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  37.54 
 
 		 549 aa  157  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  37.54 
 
 		 549 aa  157  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  37.54 
 
 		 549 aa  157  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  37.54 
 
 		 549 aa  157  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  37.54 
 
 		 549 aa  157  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  37.54 
 
 		 549 aa  157  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  37.54 
 
 		 549 aa  157  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  36.87 
 
 		 549 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 		 425 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  34.3 
 
 		 548 aa  151  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  41.79 
 
 		 545 aa  151  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  33.82 
 
 		 552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  30.42 
 
 		 531 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  34.74 
 
 		 548 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 532 aa  146  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 532 aa  145  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  36.64 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  32.59 
 
 		 534 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  38.43 
 
 		 545 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  35.91 
 
 		 560 aa  144  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 546 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.5 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 		 549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 		 549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  35.34 
 
 		 549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0497  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.56 
 
 		 695 aa  140  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  33.06 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  34.2 
 
 		 537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.15 
 
 		 524 aa  137  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.86 
 
 		 537 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  32.9 
 
 		 521 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  29.79 
 
 		 533 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 829 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.23 
 
 		 525 aa  127  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 524 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  30.87 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.81 
 
 		 528 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 423 aa  125  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  34.75 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.21 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  34.09 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  34.09 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>