More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4011 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  63.53 
 
 		 520 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 521 aa  1020    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  57.25 
 
 		 527 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  52.98 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  34.87 
 
 		 533 aa  250  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  34.87 
 
 		 533 aa  250  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  37.4 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  37.4 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  33.79 
 
 		 705 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  32.53 
 
 		 547 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 		 832 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  32.32 
 
 		 517 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 		 517 aa  183  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 		 517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 		 538 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 		 538 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  33.41 
 
 		 682 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 		 524 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  28.98 
 
 		 531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 680 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  34.75 
 
 		 399 aa  163  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 832 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 832 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  28.49 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.54 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  27.88 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  27.02 
 
 		 533 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 424 aa  156  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  33.43 
 
 		 417 aa  154  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 		 420 aa  153  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.42 
 
 		 537 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 		 425 aa  153  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  36.5 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.31 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  31.71 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  29.32 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.03 
 
 		 528 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 		 537 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 		 418 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  29.8 
 
 		 835 aa  150  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  34.5 
 
 		 424 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  28.92 
 
 		 525 aa  149  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  34.5 
 
 		 424 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 420 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  31.82 
 
 		 427 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  33.49 
 
 		 531 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  31.18 
 
 		 788 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  29.43 
 
 		 534 aa  147  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  30.62 
 
 		 1247 aa  146  9e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  28.82 
 
 		 524 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  28.72 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 		 419 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  25.51 
 
 		 535 aa  144  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  31.47 
 
 		 444 aa  143  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  34.73 
 
 		 411 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  29.41 
 
 		 621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  28.63 
 
 		 531 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  27.79 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  34.17 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  34.17 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  36.31 
 
 		 417 aa  140  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  27.77 
 
 		 532 aa  139  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  27.33 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  34.24 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 		 519 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  27.33 
 
 		 527 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4815  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 		 551 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 		 417 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  30.06 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  27.39 
 
 		 563 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  35.71 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30.69 
 
 		 527 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 		 418 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  27.21 
 
 		 563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  27.21 
 
 		 563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  32.83 
 
 		 725 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  28.37 
 
 		 535 aa  137  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  27.21 
 
 		 563 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 		 532 aa  136  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  25.99 
 
 		 527 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  27.9 
 
 		 548 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  34.53 
 
 		 418 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  29.32 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  34.26 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  27.51 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  32.85 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  26.52 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>