More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0652 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 436 aa  867    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  56.42 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  55.82 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  55.48 
 
 		 425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  58.38 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  53.85 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  51.87 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  50.34 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  47.2 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  44.24 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  44.63 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  44.63 
 
 		 434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  44.01 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  44.68 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  43.78 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.29 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  44.94 
 
 		 417 aa  309  8e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  44.47 
 
 		 417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  42.96 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  39.95 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  42.32 
 
 		 419 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  41.73 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  39.89 
 
 		 418 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 420 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  38.6 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  40.66 
 
 		 427 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  37.6 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  40.06 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  42.78 
 
 		 422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  41.8 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  39.56 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  39.08 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  37.38 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  41.87 
 
 		 424 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  41.71 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  36.71 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  43.37 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  37.4 
 
 		 417 aa  256  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.56 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  39.69 
 
 		 411 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  40.5 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  39.39 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  40.22 
 
 		 411 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  39.85 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  40.45 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  36.84 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  40.22 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  35.61 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  33.1 
 
 		 410 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  35.55 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  34.97 
 
 		 533 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  34.97 
 
 		 533 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  36.39 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  32.33 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  32.85 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  31.98 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  32.08 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.06 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  30.11 
 
 		 524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 527 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.2 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 		 531 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  30.63 
 
 		 832 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 526 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  26.89 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 526 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 526 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.96 
 
 		 526 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 526 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 526 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  27.54 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 526 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  31.1 
 
 		 812 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 		 680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  31.45 
 
 		 832 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  26.88 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  31.45 
 
 		 832 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  28.57 
 
 		 874 aa  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 		 547 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.26 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  27.51 
 
 		 526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  26.2 
 
 		 536 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 524 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 532 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 532 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 		 531 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  28.16 
 
 		 527 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  30.94 
 
 		 537 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.33 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  26.8 
 
 		 527 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  28.81 
 
 		 533 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  26.28 
 
 		 526 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 		 517 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  27.7 
 
 		 1247 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  26.82 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.56 
 
 		 524 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>