More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2829 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  92.36 
 
 		 434 aa  729    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  88.45 
 
 		 434 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  87.76 
 
 		 434 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  88.22 
 
 		 434 aa  700    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 434 aa  854    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  98.62 
 
 		 434 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.02 
 
 		 389 aa  710    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  88.22 
 
 		 434 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  67.86 
 
 		 428 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  50.48 
 
 		 426 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  48.62 
 
 		 444 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  48.21 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  48.54 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  49.14 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  44.01 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  45.43 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  42.22 
 
 		 417 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  41.75 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 		 420 aa  269  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 418 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  37.91 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  38.75 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  38.9 
 
 		 418 aa  249  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  38.21 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  37.91 
 
 		 416 aa  242  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  40.29 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  36.98 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  39.72 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  36.47 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  37.5 
 
 		 424 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  39.25 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  37.44 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  38.16 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  37.94 
 
 		 419 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  35.89 
 
 		 418 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  36.9 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  37.62 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  41.69 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  40.53 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  37.92 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  38 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  38 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 		 421 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  32.4 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  37.77 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  34.71 
 
 		 427 aa  203  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  38.24 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  35 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 		 533 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 		 533 aa  139  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  27.99 
 
 		 521 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  28.73 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.83 
 
 		 528 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  31.84 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 680 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  31.83 
 
 		 527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  31.06 
 
 		 397 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  30.79 
 
 		 553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  31.83 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  30.69 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  29.27 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  28.49 
 
 		 682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  28.72 
 
 		 526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  31.09 
 
 		 548 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  28.5 
 
 		 536 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.5 
 
 		 538 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  30.21 
 
 		 549 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  36.44 
 
 		 548 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  28.03 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  31.54 
 
 		 545 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.28 
 
 		 528 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 705 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.32 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  26.89 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  34.89 
 
 		 555 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 555 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  29.75 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  35.17 
 
 		 654 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  32.34 
 
 		 812 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>