More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0253 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 416 aa  799    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  48.67 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  44.71 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  44.84 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  45.12 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  45.73 
 
 		 424 aa  305  7e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  43.93 
 
 		 411 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  43.93 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  43.69 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  44.89 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  44.28 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  38.35 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  43.63 
 
 		 418 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  39.81 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  42.18 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  39.34 
 
 		 425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  43.27 
 
 		 424 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  38.78 
 
 		 434 aa  282  8.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  43.27 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  40.29 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  38.82 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  43.69 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  37.38 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  38.33 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  36.93 
 
 		 444 aa  276  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  38.6 
 
 		 436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  36.84 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  45.14 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  43.42 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  40.21 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  41 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  44.74 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  43 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  41.01 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  41.65 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.84 
 
 		 435 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  38.26 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  40 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  36.94 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  35.49 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 		 410 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  39.89 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.21 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  40.22 
 
 		 434 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  38.12 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  40.33 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  40.06 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  40.06 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  39.78 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  31.08 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  28.74 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  29.76 
 
 		 533 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  29.76 
 
 		 533 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  28.5 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  34.34 
 
 		 534 aa  106  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  29.58 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.25 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 520 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  31.27 
 
 		 682 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 		 527 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 		 531 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  30.5 
 
 		 680 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  29.48 
 
 		 521 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 526 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.39 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.39 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 		 526 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  29.53 
 
 		 527 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  27.25 
 
 		 526 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  27.25 
 
 		 526 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  28.24 
 
 		 525 aa  95.5  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  27.25 
 
 		 526 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.45 
 
 		 528 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  27.25 
 
 		 526 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  27.25 
 
 		 526 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 521 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  27.65 
 
 		 526 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  32.64 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  30.92 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22353  predicted protein  26.62 
 
 		 464 aa  94.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 526 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  29.36 
 
 		 528 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  29.68 
 
 		 527 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  29.39 
 
 		 526 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 		 527 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  29.39 
 
 		 526 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 		 527 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  26.89 
 
 		 537 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  29.39 
 
 		 526 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 		 527 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  30.26 
 
 		 812 aa  93.6  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  27.65 
 
 		 526 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 705 aa  93.2  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 526 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  30.26 
 
 		 527 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.27 
 
 		 531 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>