More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0433 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
420 aa  821    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  62.8 
 
 
434 aa  518  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  57.72 
 
 
418 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  47.23 
 
 
413 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  47.12 
 
 
424 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  46.63 
 
 
424 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  45.54 
 
 
411 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  45.54 
 
 
411 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  44.82 
 
 
419 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  45.54 
 
 
411 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  44.1 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  43.59 
 
 
421 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  44.42 
 
 
419 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.03 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  42.79 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  41.75 
 
 
418 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  45.95 
 
 
422 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  45.63 
 
 
411 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  41.98 
 
 
418 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  40.67 
 
 
410 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  43.74 
 
 
427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  40.57 
 
 
415 aa  311  9e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  39.67 
 
 
424 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  44.15 
 
 
423 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  41.25 
 
 
417 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  42.96 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.33 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  41.33 
 
 
422 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  40.91 
 
 
417 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  40.77 
 
 
420 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  38.92 
 
 
417 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  38.35 
 
 
416 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  38.44 
 
 
417 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  40 
 
 
436 aa  276  6e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  36.3 
 
 
444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  35.71 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  38.63 
 
 
437 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  35.68 
 
 
427 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  36.5 
 
 
417 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  36.21 
 
 
427 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  35.65 
 
 
426 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  38.97 
 
 
434 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  38.97 
 
 
434 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  35.65 
 
 
428 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  38.97 
 
 
434 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  38.26 
 
 
434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 
434 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.43 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  35.68 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 
533 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 
533 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 
397 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  32.7 
 
 
397 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  33.99 
 
 
531 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 
521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 
527 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  29.89 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  29.58 
 
 
705 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  26.12 
 
 
536 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 
517 aa  116  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  28.96 
 
 
531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  26.67 
 
 
531 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  24.86 
 
 
534 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  24.86 
 
 
524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  30.03 
 
 
547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  25.28 
 
 
526 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  27.32 
 
 
368 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
538 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
538 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  24.44 
 
 
526 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
526 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 
517 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
526 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  26.47 
 
 
527 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
526 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
526 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
526 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
526 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  24.53 
 
 
526 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
526 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  25.75 
 
 
528 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 
517 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  26.65 
 
 
538 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  28.03 
 
 
682 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  23.99 
 
 
521 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 
725 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  28.91 
 
 
812 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  26.63 
 
 
527 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1887  Na+/H+ exchanger family protein  27.97 
 
 
689 aa  97.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  27.75 
 
 
680 aa  97.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  24.22 
 
 
511 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  26.87 
 
 
532 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.87 
 
 
532 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  24.73 
 
 
537 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  27.75 
 
 
537 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  23.27 
 
 
526 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  25.73 
 
 
527 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>