More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3954 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  64.54 
 
 		 703 aa  784    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 725 aa  1419    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  64.54 
 
 		 703 aa  784    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  40.24 
 
 		 874 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  37.86 
 
 		 832 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  38.92 
 
 		 835 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  38.37 
 
 		 832 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  38.37 
 
 		 832 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  39.36 
 
 		 788 aa  360  8e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  48.66 
 
 		 431 aa  310  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  44.24 
 
 		 435 aa  283  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  30.09 
 
 		 682 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  29.38 
 
 		 680 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  34.17 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  33.62 
 
 		 812 aa  153  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  38.07 
 
 		 527 aa  149  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 		 705 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  33.59 
 
 		 533 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  33.59 
 
 		 533 aa  144  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  31.84 
 
 		 531 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  31.83 
 
 		 399 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.03 
 
 		 536 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 		 538 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 		 538 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  32.71 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 517 aa  125  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 527 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  32.43 
 
 		 397 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  29.17 
 
 		 1247 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  30.64 
 
 		 517 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 		 425 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 		 547 aa  118  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  31.96 
 
 		 525 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  31.83 
 
 		 534 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  27.46 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  30.08 
 
 		 524 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  26.78 
 
 		 524 aa  114  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  29.31 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  29.92 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 526 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 526 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 526 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 526 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 526 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 526 aa  111  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 526 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 513 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  29.23 
 
 		 425 aa  110  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  27.27 
 
 		 548 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 533 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  29.7 
 
 		 548 aa  109  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  27.27 
 
 		 534 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  28.49 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.47 
 
 		 537 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  25.74 
 
 		 531 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 		 538 aa  108  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  29.28 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  28.96 
 
 		 563 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  28.96 
 
 		 563 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  28.73 
 
 		 563 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  28.73 
 
 		 563 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  28.73 
 
 		 548 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  27.61 
 
 		 417 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  29.02 
 
 		 566 aa  104  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.89 
 
 		 688 aa  104  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  29.47 
 
 		 535 aa  103  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.76 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 		 418 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  34.99 
 
 		 424 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  29.61 
 
 		 577 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0429  Na+/H+ antiporter  34.12 
 
 		 680 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.708351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  28.65 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7391  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 		 521 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.90592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  30.92 
 
 		 527 aa  102  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  28.57 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  27.84 
 
 		 533 aa  101  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 525 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 		 548 aa  101  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  34.89 
 
 		 424 aa  101  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 525 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  28.9 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  28.34 
 
 		 549 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.02 
 
 		 435 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  26 
 
 		 527 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 		 525 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.07 
 
 		 553 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  31.2 
 
 		 624 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>