More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2906 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 431 aa  824    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  53.08 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  48.66 
 
 		 725 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  43.97 
 
 		 703 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  43.97 
 
 		 703 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  40.1 
 
 		 832 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  39.13 
 
 		 832 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  39.13 
 
 		 832 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  38.01 
 
 		 874 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  38.66 
 
 		 835 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  42.78 
 
 		 788 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.14 
 
 		 682 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 680 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 		 520 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  31.47 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  31.47 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  30.06 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  31.2 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 705 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  30.13 
 
 		 536 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  29.14 
 
 		 812 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 		 531 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 537 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  28.69 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 537 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  30.83 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  27.22 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  28.73 
 
 		 521 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  29.19 
 
 		 527 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.62 
 
 		 527 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  27.88 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  28 
 
 		 533 aa  96.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  26.63 
 
 		 534 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 		 428 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  30.53 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  26.22 
 
 		 524 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  32.31 
 
 		 624 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  30.27 
 
 		 537 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 		 526 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 		 526 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 		 526 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 		 526 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  25.33 
 
 		 533 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 		 526 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 		 526 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.91 
 
 		 526 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  32.49 
 
 		 547 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  26.36 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  28.68 
 
 		 525 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.15 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  29.33 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  30.63 
 
 		 521 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  31.36 
 
 		 423 aa  86.7  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 		 524 aa  86.3  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 538 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  29.07 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 538 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  26.48 
 
 		 1247 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  29.78 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  32.12 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  32.12 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  31.82 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  30.25 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  29.83 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  27.66 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  29.49 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  30.84 
 
 		 538 aa  81.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  25.49 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2818  Na+/H+ antiporter  32.35 
 
 		 621 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000552093  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 524 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  29.28 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  27.3 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2781  sodium/hydrogen exchanger  33.21 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.392018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  29.3 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  28.66 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  27.5 
 
 		 666 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.21 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>