More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2350 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  92.3 
 
 		 832 aa  1457    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  59.15 
 
 		 835 aa  830    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 832 aa  1628    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  59.87 
 
 		 788 aa  804    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  92.3 
 
 		 832 aa  1457    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  38 
 
 		 874 aa  512  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 		 725 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  36.95 
 
 		 703 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  36.95 
 
 		 703 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  39.71 
 
 		 431 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 		 435 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  32.34 
 
 		 682 aa  204  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 680 aa  203  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  31.57 
 
 		 520 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  30.49 
 
 		 812 aa  164  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  33.26 
 
 		 527 aa  157  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 533 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 533 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 531 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  29.31 
 
 		 1247 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  30.66 
 
 		 399 aa  139  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 705 aa  134  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.61 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  26.72 
 
 		 537 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 538 aa  130  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 425 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  33.97 
 
 		 536 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  28.9 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.04 
 
 		 537 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  30.11 
 
 		 436 aa  125  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 		 397 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  31.12 
 
 		 368 aa  124  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  30.82 
 
 		 397 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  29.14 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  29.43 
 
 		 425 aa  122  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  27.64 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  32.19 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  29.02 
 
 		 417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  28.95 
 
 		 524 aa  119  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  30.43 
 
 		 554 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 		 517 aa  118  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  27.68 
 
 		 533 aa  117  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48886  predicted protein  28.51 
 
 		 813 aa  117  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515683  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.56 
 
 		 551 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  30.23 
 
 		 560 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 		 426 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  26.34 
 
 		 548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  30.98 
 
 		 551 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  30.02 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  26.32 
 
 		 548 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  25.37 
 
 		 531 aa  111  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 550 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.67 
 
 		 532 aa  110  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  29.95 
 
 		 549 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  29 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  29.34 
 
 		 531 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.44 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  27.44 
 
 		 527 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  29.27 
 
 		 547 aa  108  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  26.15 
 
 		 524 aa  108  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 526 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 526 aa  108  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 526 aa  108  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 526 aa  108  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 526 aa  108  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 526 aa  108  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 624 aa  107  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 410 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  26.05 
 
 		 563 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  26.05 
 
 		 563 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  29.46 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  27.56 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  26.05 
 
 		 563 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  29.72 
 
 		 526 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  26.05 
 
 		 563 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 		 538 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  27.6 
 
 		 538 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  27.88 
 
 		 525 aa  106  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  26.05 
 
 		 548 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 		 531 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  28.73 
 
 		 427 aa  105  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 423 aa  105  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 		 434 aa  104  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 555 aa  104  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 422 aa  104  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.36 
 
 		 528 aa  104  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 		 534 aa  104  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  28.23 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 		 434 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  30.5 
 
 		 633 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  26.33 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  28.33 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  29.35 
 
 		 555 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  29.28 
 
 		 654 aa  103  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  28.54 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 		 434 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 		 434 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>