272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48886 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48886  predicted protein  100 
 
 		 813 aa  1668    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515683  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  61.68 
 
 		 368 aa  435  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 680 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  27.86 
 
 		 682 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  28.5 
 
 		 1247 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  31.12 
 
 		 812 aa  161  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 		 531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 832 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  26.21 
 
 		 832 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 		 832 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  27.1 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  27.1 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  28.65 
 
 		 705 aa  101  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 		 520 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  24.54 
 
 		 835 aa  99.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  26.1 
 
 		 874 aa  97.8  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  27.9 
 
 		 521 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 		 425 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  31.95 
 
 		 525 aa  92.4  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  32.28 
 
 		 424 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 		 418 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  22.45 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  31.5 
 
 		 424 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 		 531 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  27.53 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  30.04 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 705 aa  83.2  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  26.34 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.41 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  24.8 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  25.63 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 		 788 aa  81.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  23.08 
 
 		 536 aa  81.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  30.07 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  28.24 
 
 		 423 aa  80.1  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  25.93 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  25.93 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  27.41 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  27.59 
 
 		 526 aa  77.4  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  29.18 
 
 		 419 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0497  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  23.81 
 
 		 695 aa  77.4  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  29.86 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  25.35 
 
 		 770 aa  76.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  29.82 
 
 		 427 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  26.84 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  24.15 
 
 		 533 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  27.95 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  29.75 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.24 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  26.36 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  24.95 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  25.86 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  24.75 
 
 		 533 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  24.57 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.84 
 
 		 527 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  24.51 
 
 		 524 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22353  predicted protein  26.56 
 
 		 464 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  24.57 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  24.57 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  27.93 
 
 		 531 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  25.19 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  31.75 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  27.67 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  24.57 
 
 		 563 aa  73.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  27.78 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  25 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  27.56 
 
 		 524 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02288  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.93 
 
 		 703 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.91 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 		 419 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  26.06 
 
 		 581 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  30.05 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  30.68 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  26.55 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  32.43 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  25.44 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  25.5 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  27.09 
 
 		 524 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  25.69 
 
 		 523 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>