234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22353 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_22353  predicted protein  100 
 
 
464 aa  946    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1871  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  39.09 
 
 
427 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04380  monovalent inorganic cation transporter, putative  32.27 
 
 
698 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14403  phospholipase  34.99 
 
 
359 aa  203  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990038  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02288  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  32.24 
 
 
703 aa  199  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78097  monovalent cation:H+ antiporter, CPA1 family (NHX1)  30.6 
 
 
653 aa  195  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147084  normal  0.966822 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1764  predicted protein  34.88 
 
 
389 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289242  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2316  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  36.89 
 
 
357 aa  193  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967211  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43552  predicted protein  28.51 
 
 
971 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774573  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43052  predicted protein  25.73 
 
 
704 aa  136  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  27.96 
 
 
521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 
531 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 
520 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  28.69 
 
 
527 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 
416 aa  94.4  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  27.51 
 
 
399 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
680 aa  87.8  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  25.53 
 
 
537 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  24.78 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  25.83 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  23.85 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  25.49 
 
 
424 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  29.21 
 
 
812 aa  79.7  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  23.88 
 
 
527 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  26.59 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  26.17 
 
 
682 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  24.82 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  23.51 
 
 
531 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  23.04 
 
 
534 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  24.42 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  22.99 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  23.32 
 
 
537 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  23.02 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  23.88 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.11 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  24.61 
 
 
832 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  26.59 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  26.82 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  24.79 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  24.11 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  22 
 
 
534 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  25.86 
 
 
832 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  25.86 
 
 
832 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  25.21 
 
 
705 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  24.79 
 
 
434 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 
434 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  24.19 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  24.59 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  23.46 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  25.12 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  25.12 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  25.12 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  25.12 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  25.12 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  24.24 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  24.88 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  24.15 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  26.42 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  25.24 
 
 
528 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  22.63 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  22.63 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  24.15 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  24.88 
 
 
526 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  24.3 
 
 
585 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  24.3 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  24.3 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  23.51 
 
 
654 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17670  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  25.2 
 
 
566 aa  66.6  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  22.85 
 
 
527 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0637  sodium/hydrogen exchanger  24.36 
 
 
581 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  23.81 
 
 
538 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  24.35 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  24.84 
 
 
533 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  24.11 
 
 
524 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  23.75 
 
 
547 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  24.14 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  21.01 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  24.19 
 
 
563 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  23.72 
 
 
555 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.35 
 
 
389 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  24.19 
 
 
563 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  21.98 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  24.19 
 
 
548 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  23.92 
 
 
563 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  24.52 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  23.92 
 
 
563 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  24.22 
 
 
423 aa  64.3  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>