More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3008 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  96.02 
 
 		 434 aa  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  96.02 
 
 		 434 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 389 aa  768    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  92.31 
 
 		 434 aa  624  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  88.06 
 
 		 434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  88.06 
 
 		 434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  87.8 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  87 
 
 		 434 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  49.05 
 
 		 426 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  48.51 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  47.55 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  48.87 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  49.71 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  45.7 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  45.14 
 
 		 436 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  47.04 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  41.42 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  41.14 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  39.21 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  39.08 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  38.32 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  37.9 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  39.89 
 
 		 416 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  36.44 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  38.1 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  37.13 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  39.36 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  39.73 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  36.86 
 
 		 424 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  38.83 
 
 		 424 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  38.56 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  36.22 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  38.46 
 
 		 419 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  36.84 
 
 		 427 aa  199  9e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  39.47 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  38.33 
 
 		 419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  41.85 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  34.99 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  41.29 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  36.22 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  39.53 
 
 		 421 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  37.09 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  35.23 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  30.1 
 
 		 533 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  30.1 
 
 		 533 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  36.14 
 
 		 531 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  29.65 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  29.18 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  36.44 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  36.02 
 
 		 548 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  35.32 
 
 		 555 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  35.59 
 
 		 654 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  34.89 
 
 		 555 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  34.89 
 
 		 555 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  34.89 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 633 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  34.89 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  35 
 
 		 577 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  35.65 
 
 		 549 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 520 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  33.05 
 
 		 551 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 548 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 563 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 563 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 563 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  34.47 
 
 		 563 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  33.8 
 
 		 526 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  33.8 
 
 		 526 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  33.8 
 
 		 526 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  33.8 
 
 		 526 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  33.8 
 
 		 526 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  33.8 
 
 		 526 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  33.01 
 
 		 526 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  32.88 
 
 		 527 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  34.75 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  35.32 
 
 		 549 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  35.74 
 
 		 549 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  35.74 
 
 		 549 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  35.74 
 
 		 549 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  33.49 
 
 		 552 aa  95.5  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  30.28 
 
 		 528 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.37 
 
 		 528 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>