More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1058 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 428 aa  837    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  66.67 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  67.14 
 
 		 434 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  67.86 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  67.86 
 
 		 434 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  67.86 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.57 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  52.68 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  51.19 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  51.41 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  52.96 
 
 		 427 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  52.37 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  47.2 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  48.14 
 
 		 427 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  47.21 
 
 		 428 aa  349  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  41.96 
 
 		 417 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  41.49 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  38.12 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  37.79 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 410 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  36.07 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  36.24 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  34.13 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  38.61 
 
 		 413 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  36.82 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  39.45 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  39.62 
 
 		 419 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  34.55 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  34.99 
 
 		 434 aa  235  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  33.65 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  38.22 
 
 		 422 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  37.94 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  38.39 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  37.59 
 
 		 424 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  37.59 
 
 		 427 aa  229  9e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  36.26 
 
 		 415 aa  229  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  39.12 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  38.84 
 
 		 411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 		 411 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  37.8 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  38.84 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  35.85 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  34.95 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  32.78 
 
 		 437 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  29.67 
 
 		 533 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  29.67 
 
 		 533 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  29.37 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  31.98 
 
 		 531 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  30.23 
 
 		 521 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 		 682 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 680 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  27.11 
 
 		 536 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 520 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 		 705 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  30.75 
 
 		 531 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  29.21 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 		 553 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  31.17 
 
 		 517 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  28.7 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  28.7 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  28.7 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  28.7 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  28.7 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  29.37 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  29.37 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  29.14 
 
 		 832 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 		 577 aa  99.8  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 		 725 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 		 524 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 538 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 538 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  31.97 
 
 		 517 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  28.17 
 
 		 524 aa  98.6  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  28.22 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  26.75 
 
 		 548 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  29.07 
 
 		 812 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  26.87 
 
 		 548 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.06 
 
 		 537 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.88 
 
 		 532 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  26.88 
 
 		 532 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  27.05 
 
 		 528 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  28.71 
 
 		 788 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.21 
 
 		 524 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  27.81 
 
 		 548 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  25.63 
 
 		 1247 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.29 
 
 		 526 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.29 
 
 		 526 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.29 
 
 		 526 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.29 
 
 		 526 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.29 
 
 		 526 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  29.11 
 
 		 549 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  29.35 
 
 		 533 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  28.13 
 
 		 549 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>