More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29184 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  100 
 
 
1247 aa  2557    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  32.97 
 
 
812 aa  240  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  30.04 
 
 
680 aa  225  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  30.34 
 
 
682 aa  221  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  37.74 
 
 
368 aa  171  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  31.37 
 
 
531 aa  155  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  31.48 
 
 
533 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  31.48 
 
 
533 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  30.05 
 
 
399 aa  141  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48886  predicted protein  27.91 
 
 
813 aa  139  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  31.34 
 
 
521 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 
520 aa  131  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  28.21 
 
 
874 aa  131  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  29.93 
 
 
397 aa  127  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 
397 aa  127  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  29.54 
 
 
531 aa  127  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  29.77 
 
 
832 aa  126  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  29.77 
 
 
832 aa  126  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 
705 aa  125  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
832 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  26.47 
 
 
527 aa  119  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 
527 aa  119  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  27.6 
 
 
526 aa  118  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  27.35 
 
 
526 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  27.35 
 
 
526 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  27.35 
 
 
526 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  27.35 
 
 
526 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  27.35 
 
 
526 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  29.12 
 
 
553 aa  117  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  28.12 
 
 
524 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  26.81 
 
 
526 aa  115  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  28.15 
 
 
835 aa  112  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  25.24 
 
 
534 aa  111  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  27.62 
 
 
527 aa  110  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  29.14 
 
 
788 aa  109  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 
725 aa  109  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 
423 aa  108  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  28.45 
 
 
547 aa  108  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.6 
 
 
527 aa  108  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  27.87 
 
 
526 aa  107  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  24.74 
 
 
533 aa  107  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4815  sodium/hydrogen exchanger  28.66 
 
 
551 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  29.05 
 
 
444 aa  105  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 
436 aa  105  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  26.3 
 
 
537 aa  105  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  25.3 
 
 
538 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  25.3 
 
 
538 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  24.31 
 
 
531 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  27.15 
 
 
526 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  26.61 
 
 
425 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.84 
 
 
524 aa  102  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  29.46 
 
 
517 aa  103  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  28.03 
 
 
517 aa  102  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 
524 aa  101  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.16 
 
 
528 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  29.89 
 
 
417 aa  101  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  26.32 
 
 
528 aa  100  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
526 aa  100  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.15 
 
 
524 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  25.06 
 
 
538 aa  100  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  27.25 
 
 
550 aa  99.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  26.65 
 
 
534 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  27.61 
 
 
427 aa  99.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 
517 aa  99.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  26.3 
 
 
526 aa  98.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  29.29 
 
 
530 aa  98.2  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  27.22 
 
 
425 aa  97.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  26.42 
 
 
537 aa  97.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
526 aa  97.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 
703 aa  96.3  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  27.73 
 
 
539 aa  96.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 
703 aa  96.3  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 
424 aa  96.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.2 
 
 
434 aa  95.5  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  31.23 
 
 
419 aa  95.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.65 
 
 
424 aa  94.7  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  24.88 
 
 
536 aa  94.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  25.92 
 
 
531 aa  94.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  24.19 
 
 
698 aa  94.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  30.86 
 
 
427 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  31.06 
 
 
424 aa  94  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  29.58 
 
 
417 aa  93.2  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  27.3 
 
 
525 aa  92.8  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  31.06 
 
 
424 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
427 aa  92.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  27.95 
 
 
527 aa  92.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 
526 aa  92.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
526 aa  92  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
526 aa  92  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  29.26 
 
 
417 aa  91.7  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  27.01 
 
 
537 aa  91.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
434 aa  91.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  27.71 
 
 
527 aa  91.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 
426 aa  91.3  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  29.63 
 
 
624 aa  90.9  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  27.67 
 
 
527 aa  90.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 
418 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  24.74 
 
 
526 aa  89.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
419 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
526 aa  89.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>