More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0680 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
705 aa  1424    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  34.73 
 
 
521 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  34.32 
 
 
531 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  34.32 
 
 
527 aa  208  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  32.37 
 
 
533 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  32.37 
 
 
533 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  35.77 
 
 
520 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 
538 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 
538 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 
680 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  33.4 
 
 
517 aa  177  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.24 
 
 
524 aa  176  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  33.97 
 
 
397 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 
397 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 
517 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
682 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  30.74 
 
 
517 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
420 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  29.35 
 
 
547 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  33.97 
 
 
399 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.48 
 
 
528 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 
725 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 
434 aa  155  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  32.48 
 
 
424 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  33.06 
 
 
427 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  30.28 
 
 
835 aa  154  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  32.02 
 
 
424 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.57 
 
 
532 aa  152  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  31.63 
 
 
419 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  27.96 
 
 
526 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  27.62 
 
 
532 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  34.82 
 
 
812 aa  150  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  27.6 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  26.85 
 
 
537 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  27.6 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  27.6 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  27.6 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  27.6 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 
411 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  32.5 
 
 
417 aa  149  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  27.6 
 
 
526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  30.48 
 
 
537 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  32.71 
 
 
1247 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  25.78 
 
 
526 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 
424 aa  147  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  31.67 
 
 
417 aa  146  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  35.52 
 
 
423 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 
411 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  29.48 
 
 
832 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  31.75 
 
 
874 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  28.63 
 
 
531 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  30.44 
 
 
413 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  31.73 
 
 
428 aa  144  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  26.91 
 
 
527 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 
427 aa  144  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  27.16 
 
 
525 aa  143  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  30.21 
 
 
527 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  30.31 
 
 
418 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.9 
 
 
424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  26.79 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  31.43 
 
 
424 aa  141  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 
419 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  28.98 
 
 
788 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 
410 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4815  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 
551 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  26.03 
 
 
531 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 
832 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  25.65 
 
 
526 aa  140  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  29.9 
 
 
832 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 
526 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 
418 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  26.4 
 
 
524 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  28.36 
 
 
534 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.19 
 
 
435 aa  137  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.56 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  27.63 
 
 
524 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  30.96 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 
416 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 
527 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  28.37 
 
 
415 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 
527 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 
527 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  23.92 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 
418 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 
417 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.1 
 
 
434 aa  134  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 
422 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  27.29 
 
 
527 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  27.51 
 
 
527 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 
426 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  25.09 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  26.04 
 
 
527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  29.15 
 
 
418 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 
421 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  25.49 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 
420 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 
417 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  25.24 
 
 
536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  24.95 
 
 
535 aa  129  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>