More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3351 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 420 aa  806    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  80.43 
 
 		 417 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  66.18 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  56.83 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  56.12 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  54.13 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  46.23 
 
 		 435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  43.76 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  44.63 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  43 
 
 		 418 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  40.53 
 
 		 420 aa  308  9e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  41.36 
 
 		 424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  44.1 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  41.36 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  45.91 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  43.1 
 
 		 437 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  40.87 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  41.35 
 
 		 419 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  45.14 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  43.57 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  43.33 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  42.13 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  42.43 
 
 		 418 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  43.1 
 
 		 411 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  36.93 
 
 		 427 aa  279  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  38.25 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  39.08 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  43.23 
 
 		 424 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  43.23 
 
 		 424 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  35.78 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  36.02 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  39.07 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  38.2 
 
 		 434 aa  274  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  40.91 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  39.61 
 
 		 410 aa  268  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  42.99 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  37.86 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  37.38 
 
 		 417 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  35.18 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  40.34 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  38.75 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  37.33 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  37.87 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  37.6 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  38.21 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.48 
 
 		 434 aa  229  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  37.06 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 		 428 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  34.45 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.34 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  35.96 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 531 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  31.64 
 
 		 399 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  31.29 
 
 		 533 aa  136  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  31.29 
 
 		 533 aa  136  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  31.36 
 
 		 527 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  30 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.87 
 
 		 682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  33.95 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  31.75 
 
 		 534 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 		 538 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  33.14 
 
 		 526 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 680 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  31.74 
 
 		 517 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  30.66 
 
 		 547 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 538 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 538 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.25 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.73 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 537 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 705 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  32.76 
 
 		 526 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 		 521 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 526 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.76 
 
 		 532 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  29.38 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 517 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 527 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  32.53 
 
 		 533 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.8 
 
 		 526 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  28.36 
 
 		 812 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  32.53 
 
 		 533 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  26.53 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  32.53 
 
 		 533 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.09 
 
 		 525 aa  94.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 		 527 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 		 526 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  30.96 
 
 		 537 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>