More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3528 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 410 aa  798    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  54.41 
 
 		 415 aa  411  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  42.2 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  40.67 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  42.89 
 
 		 418 aa  315  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  39.36 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  39.12 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  40.29 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 		 427 aa  286  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  38.98 
 
 		 434 aa  286  5.999999999999999e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  40.2 
 
 		 411 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  39.95 
 
 		 411 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  39.27 
 
 		 422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  38.73 
 
 		 424 aa  282  9e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  38.85 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  40.2 
 
 		 411 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  38.73 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  38.85 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  39.95 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  39.46 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  37.8 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  39.61 
 
 		 420 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  37.32 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  38.39 
 
 		 417 aa  263  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  38.59 
 
 		 424 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  37.53 
 
 		 421 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  38.59 
 
 		 424 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  39.38 
 
 		 423 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  34.64 
 
 		 416 aa  239  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  35.32 
 
 		 427 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  35.25 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  34.05 
 
 		 425 aa  236  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  36.3 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  36.27 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  35.8 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  34.76 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  36.45 
 
 		 427 aa  223  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  33.96 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  36.43 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  37.04 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  37.57 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  37.57 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  36.72 
 
 		 434 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.01 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  36.72 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  33.1 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.82 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  28.82 
 
 		 533 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  28.82 
 
 		 533 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  29.1 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  32.38 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 531 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  30.03 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  26.87 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  31.21 
 
 		 531 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  29.89 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  29.89 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  32.14 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.41 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.41 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  31.55 
 
 		 527 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 525 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  27.99 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  27.4 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  30.03 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  30.75 
 
 		 526 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 		 527 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 511 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 		 680 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  29.46 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  29.46 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  29.46 
 
 		 527 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  28.16 
 
 		 538 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  27.45 
 
 		 536 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  31.99 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  31.23 
 
 		 526 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 705 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 526 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  28.28 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.51 
 
 		 682 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  29.11 
 
 		 533 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 		 538 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>