More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5804 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 418 aa  827    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  49.76 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  48 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  47.24 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  46.06 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  44.1 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  48 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  44.12 
 
 		 418 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  44.42 
 
 		 418 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  42.2 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  46.7 
 
 		 411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  46.94 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.41 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  46.75 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  43.38 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  47.12 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  46.94 
 
 		 411 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  46.7 
 
 		 421 aa  315  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  43.45 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  40.29 
 
 		 415 aa  308  9e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  41.9 
 
 		 427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  40.95 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  42.09 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 434 aa  305  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  45.37 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  46.94 
 
 		 411 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  43 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  41.45 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  41.87 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  39.81 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  37.14 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  45.12 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  41.2 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  36.85 
 
 		 444 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  40.72 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  36.07 
 
 		 426 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  36.8 
 
 		 427 aa  272  9e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  41.39 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  37.72 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  37.38 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 		 427 aa  259  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  37.86 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  41.06 
 
 		 434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  40.78 
 
 		 434 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  40.61 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.16 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  40.61 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  40.06 
 
 		 434 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  40.33 
 
 		 434 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  36.67 
 
 		 428 aa  229  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.33 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  29.77 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  29.77 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  30.34 
 
 		 397 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  29.23 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 		 531 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  28.65 
 
 		 538 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  32.07 
 
 		 521 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 520 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  29.92 
 
 		 527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 		 517 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 534 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 527 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 538 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 		 538 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  29.41 
 
 		 525 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.49 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  29.27 
 
 		 517 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 526 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.49 
 
 		 526 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  30.65 
 
 		 527 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 526 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.49 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  29.67 
 
 		 531 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  30.19 
 
 		 527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  29.91 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  28.42 
 
 		 537 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  30.48 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  27.45 
 
 		 536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 		 527 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  27.8 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  27.99 
 
 		 526 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  33.04 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  28.18 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  27.06 
 
 		 812 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.26 
 
 		 524 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  29.01 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 		 533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  30.11 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  28.14 
 
 		 524 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>