More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31800 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  100 
 
 
423 aa  818    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  74.29 
 
 
424 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  73.58 
 
 
424 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  64.07 
 
 
419 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  64.3 
 
 
419 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  65.45 
 
 
411 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  65.45 
 
 
411 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  66.27 
 
 
421 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  64.88 
 
 
411 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  65.61 
 
 
411 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  52.05 
 
 
427 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  49.88 
 
 
424 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  49.64 
 
 
424 aa  371  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  50.72 
 
 
413 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  44.63 
 
 
420 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  46.12 
 
 
422 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  45.12 
 
 
418 aa  310  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  46.82 
 
 
418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  44.84 
 
 
424 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  42.62 
 
 
434 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  43.1 
 
 
418 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  43.36 
 
 
417 aa  291  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  41.08 
 
 
444 aa  289  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  42.86 
 
 
417 aa  289  8e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  45.77 
 
 
427 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  42.93 
 
 
435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 
418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  39.95 
 
 
427 aa  279  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  40.63 
 
 
427 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  40.59 
 
 
425 aa  279  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  40.44 
 
 
426 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  40.29 
 
 
417 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  41.65 
 
 
416 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  43.37 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 
422 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  41.75 
 
 
417 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  43.51 
 
 
437 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  39.38 
 
 
410 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  40.34 
 
 
420 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  37.41 
 
 
415 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  36.89 
 
 
428 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  38.63 
 
 
417 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  40.53 
 
 
434 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  40.53 
 
 
434 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.38 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  40.11 
 
 
434 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  40.27 
 
 
434 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  40.27 
 
 
434 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  39.84 
 
 
434 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 
428 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.13 
 
 
389 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  34.84 
 
 
533 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  34.84 
 
 
533 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  36.26 
 
 
531 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  29.6 
 
 
534 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  33.98 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  32.78 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 
517 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
538 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 
538 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  30.15 
 
 
531 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  33.97 
 
 
547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  31.34 
 
 
531 aa  126  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.61 
 
 
538 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  33.52 
 
 
527 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 
526 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
526 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 
526 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  31.35 
 
 
521 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  32.81 
 
 
517 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 
526 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 
526 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 
526 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.34 
 
 
526 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.04 
 
 
526 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  28.35 
 
 
527 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  28.4 
 
 
526 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  29.97 
 
 
528 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 
533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  32.29 
 
 
531 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.5 
 
 
528 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.02 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 
526 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 
537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  35.07 
 
 
705 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  31.77 
 
 
533 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 
524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  31.66 
 
 
812 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 
526 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  32.09 
 
 
553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 
680 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  31.7 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  28.53 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  30.58 
 
 
526 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  32.96 
 
 
517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  28.13 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>