More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2454 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 533 aa  1055    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 533 aa  1055    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  77.66 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  77.41 
 
 		 397 aa  594  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  36.4 
 
 		 547 aa  250  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  34.87 
 
 		 521 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  37.53 
 
 		 531 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 520 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  38.37 
 
 		 527 aa  231  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  35.6 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  31.74 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  31.74 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  32.1 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 		 517 aa  206  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 680 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  36.63 
 
 		 682 aa  190  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.21 
 
 		 524 aa  178  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 705 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  30.82 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  31.6 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  30.62 
 
 		 526 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  27.56 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  29.13 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4815  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  31.73 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  31.91 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  36.96 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  27.04 
 
 		 533 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  31.34 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  36.68 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.24 
 
 		 524 aa  160  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  35.36 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  36.03 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  27.79 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  29.34 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.26 
 
 		 524 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  29.05 
 
 		 526 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  26.45 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  31.12 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  27.29 
 
 		 531 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.05 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  34.73 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.21 
 
 		 528 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  24.52 
 
 		 534 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  28.19 
 
 		 527 aa  150  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 413 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  26.85 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  25.23 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  34.84 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  33.53 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  31.32 
 
 		 812 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 418 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  25.23 
 
 		 533 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 		 411 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  31.09 
 
 		 832 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  25.05 
 
 		 532 aa  146  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  26.78 
 
 		 536 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  27.68 
 
 		 534 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  28.41 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  30.77 
 
 		 1247 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  25.42 
 
 		 548 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 		 421 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 		 521 aa  143  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.68 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  24.67 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  31.3 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.09 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 526 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 525 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  27.68 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  27.86 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  28.15 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  30.14 
 
 		 444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 426 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  26.76 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  28.19 
 
 		 531 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  30.14 
 
 		 417 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  31.29 
 
 		 420 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 519 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  27.19 
 
 		 525 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  29.18 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>