More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0636 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 812 aa  1635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  41.54 
 
 		 680 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  42.9 
 
 		 682 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  32.97 
 
 		 1247 aa  282  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  35.64 
 
 		 368 aa  200  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  30.61 
 
 		 832 aa  187  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  30.61 
 
 		 832 aa  187  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  27.89 
 
 		 832 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  24.11 
 
 		 874 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  24.08 
 
 		 835 aa  172  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  33.42 
 
 		 533 aa  171  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  33.42 
 
 		 533 aa  171  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48886  predicted protein  31.11 
 
 		 813 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 725 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  23.56 
 
 		 788 aa  163  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  33.15 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 		 397 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  33.49 
 
 		 397 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 		 531 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  33.61 
 
 		 399 aa  150  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 		 705 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  29.6 
 
 		 521 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 425 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 703 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 703 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.45 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.45 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.45 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.45 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.45 
 
 		 526 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.45 
 
 		 526 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  31.03 
 
 		 527 aa  134  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.23 
 
 		 526 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  31.23 
 
 		 533 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  28.32 
 
 		 524 aa  132  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  33.05 
 
 		 424 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  32.86 
 
 		 424 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  26.98 
 
 		 531 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.08 
 
 		 524 aa  130  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  30.58 
 
 		 436 aa  130  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  26.84 
 
 		 537 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 		 418 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  28.8 
 
 		 528 aa  126  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  29.86 
 
 		 426 aa  126  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 		 547 aa  125  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 		 427 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  27.11 
 
 		 527 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  30.7 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  28.57 
 
 		 531 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  31.03 
 
 		 419 aa  124  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.47 
 
 		 424 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 		 525 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 		 538 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 		 538 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  28.75 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  28.08 
 
 		 533 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  26.37 
 
 		 534 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  31.22 
 
 		 423 aa  122  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  30.38 
 
 		 444 aa  121  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  30.91 
 
 		 417 aa  120  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  26.91 
 
 		 531 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.21 
 
 		 528 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 435 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  27.91 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  25.77 
 
 		 537 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  29.65 
 
 		 425 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 		 418 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 419 aa  118  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  31.04 
 
 		 424 aa  118  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  24.95 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 526 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  25.69 
 
 		 527 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 418 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  28.5 
 
 		 526 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 		 527 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 		 413 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  27.55 
 
 		 526 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 421 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.36 
 
 		 435 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  28.15 
 
 		 533 aa  115  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  27.03 
 
 		 538 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  25.74 
 
 		 534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1715  Na+/H+ antiporter  26.67 
 
 		 524 aa  113  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  27.87 
 
 		 550 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 417 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  28.13 
 
 		 526 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  27.84 
 
 		 527 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  27.49 
 
 		 527 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  28.16 
 
 		 428 aa  111  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  27.49 
 
 		 527 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 		 517 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 420 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  30.55 
 
 		 416 aa  110  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  27.08 
 
 		 526 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>