More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4985 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 435 aa  847    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  53.08 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  44.24 
 
 		 725 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  44.72 
 
 		 703 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  44.72 
 
 		 703 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  37.68 
 
 		 832 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  37.59 
 
 		 832 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  37.59 
 
 		 832 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  36.49 
 
 		 835 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  35.05 
 
 		 874 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  38.04 
 
 		 788 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 680 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  27.4 
 
 		 682 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  30.23 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.22 
 
 		 536 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  32.01 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  30.79 
 
 		 624 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  27.68 
 
 		 812 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 		 524 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  30.92 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  30.6 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  31.62 
 
 		 705 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  26.64 
 
 		 531 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  34.57 
 
 		 533 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 533 aa  93.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  30.71 
 
 		 533 aa  93.6  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  28 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  31.97 
 
 		 532 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  28.48 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  31.97 
 
 		 532 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  29.76 
 
 		 419 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  28.22 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.99 
 
 		 435 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  26.91 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  29.59 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 		 538 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 537 aa  87.4  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  27.7 
 
 		 537 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  29.13 
 
 		 526 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  26.23 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  27.4 
 
 		 424 aa  86.3  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  27.46 
 
 		 534 aa  86.3  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  28.12 
 
 		 548 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  31.3 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  28.12 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  28.12 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  28.12 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  28.12 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  30.48 
 
 		 535 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 538 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  37.2 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 538 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  25.45 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2630  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.498782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  30 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  27.17 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  26.24 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0521  Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0533  Na+/H+ antiporter  31.06 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0511  Na+/H+ antiporter  30.12 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.692975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  28.39 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  26.8 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  31.7 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  36.71 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  36.9 
 
 		 527 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  29.01 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  27.47 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78097  monovalent cation:H+ antiporter, CPA1 family (NHX1)  26.2 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147084  normal  0.966822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  27.36 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  36.22 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  30.7 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  26.22 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  28.1 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 531 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>