More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2082 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  59.61 
 
 		 788 aa  806    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  59.03 
 
 		 835 aa  843    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 832 aa  1629    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  92.3 
 
 		 832 aa  1472    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 832 aa  1629    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0013  cyclic nucleotide-regulated Na/H exchanger  38.75 
 
 		 874 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.969543  normal  0.36884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  38.19 
 
 		 725 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4378  sodium/hydrogen exchanger  37.06 
 
 		 703 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.746015  normal  0.209778 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4268  sodium/hydrogen exchanger  37.06 
 
 		 703 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.199403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2906  Sodium/hydrogen exchanger  39.09 
 
 		 431 aa  234  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 		 680 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  37.59 
 
 		 435 aa  210  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  32.87 
 
 		 682 aa  207  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  31.5 
 
 		 521 aa  190  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 		 812 aa  167  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 		 520 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  33.41 
 
 		 527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 533 aa  148  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 533 aa  148  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  31.58 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 		 531 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  30.79 
 
 		 1247 aa  140  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 705 aa  134  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.87 
 
 		 537 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 425 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.35 
 
 		 534 aa  131  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  30.37 
 
 		 436 aa  130  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  30.15 
 
 		 538 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  29.8 
 
 		 444 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  29.97 
 
 		 417 aa  127  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  30.57 
 
 		 425 aa  127  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 		 536 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  29.68 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  28.24 
 
 		 533 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.32 
 
 		 537 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  30.21 
 
 		 368 aa  118  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  30.11 
 
 		 397 aa  117  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.27 
 
 		 524 aa  117  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  31.07 
 
 		 560 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  29.89 
 
 		 397 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  28.84 
 
 		 525 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  29.37 
 
 		 532 aa  115  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  27.88 
 
 		 524 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 554 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.14 
 
 		 532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0511  Na+/H+ antiporter  30.48 
 
 		 624 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0786286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 517 aa  113  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  25.27 
 
 		 533 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  28.42 
 
 		 566 aa  112  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  27.63 
 
 		 527 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  28 
 
 		 566 aa  111  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48886  predicted protein  27.88 
 
 		 813 aa  111  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.515683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 		 538 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 		 538 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  24.02 
 
 		 531 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  29.31 
 
 		 549 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  29.64 
 
 		 546 aa  109  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  29.79 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  28.68 
 
 		 535 aa  109  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  26 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  29.94 
 
 		 551 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  25.87 
 
 		 548 aa  108  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  27.78 
 
 		 531 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 		 410 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  25.68 
 
 		 548 aa  108  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  26.71 
 
 		 548 aa  107  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.34 
 
 		 551 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  28.48 
 
 		 526 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  31.39 
 
 		 534 aa  107  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  30.86 
 
 		 577 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  31.11 
 
 		 547 aa  106  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  27.65 
 
 		 545 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.77 
 
 		 526 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  30.03 
 
 		 550 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  28.06 
 
 		 531 aa  104  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 418 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  32.09 
 
 		 418 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 		 413 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  32.1 
 
 		 420 aa  103  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 517 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1665  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 653 aa  102  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  24.81 
 
 		 666 aa  101  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  31.48 
 
 		 424 aa  101  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 		 545 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 		 434 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  25.3 
 
 		 563 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  28.12 
 
 		 524 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 		 420 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  25.3 
 
 		 563 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  25.3 
 
 		 563 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>