More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2665 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
538 aa  1048    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  72.71 
 
 
517 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  71.71 
 
 
517 aa  711    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
538 aa  1048    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  63.47 
 
 
517 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4815  sodium/hydrogen exchanger  59.2 
 
 
551 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  56.14 
 
 
547 aa  521  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  31.03 
 
 
533 aa  223  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  31.03 
 
 
533 aa  223  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  36.76 
 
 
520 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  38.94 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  30.57 
 
 
521 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  35.49 
 
 
397 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  35.49 
 
 
397 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  33.01 
 
 
531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 
705 aa  169  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  28.04 
 
 
535 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  30.1 
 
 
399 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  33.33 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 
527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  33.06 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 
534 aa  140  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  27.54 
 
 
537 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  30.24 
 
 
725 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  27.26 
 
 
550 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7625  putative sodium/hydrogen antiporter (exchanger)  25.89 
 
 
535 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  28.49 
 
 
538 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  26.89 
 
 
536 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
418 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 
531 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 
418 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 
680 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  32.06 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  28.83 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  27.23 
 
 
526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 
526 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  28.28 
 
 
553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.57 
 
 
528 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  32.96 
 
 
423 aa  134  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  30 
 
 
527 aa  133  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  26.55 
 
 
533 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.57 
 
 
524 aa  133  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0521  Na+/H+ antiporter  27.81 
 
 
550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  26.75 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  26.84 
 
 
534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  28.44 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  26.01 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  25.52 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  28.18 
 
 
537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 
425 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 
434 aa  130  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  27.85 
 
 
531 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 
419 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  30.38 
 
 
682 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0519  Na+/H+ antiporter  27.43 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 
531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  33.14 
 
 
421 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  26.1 
 
 
563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  26.1 
 
 
563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  26.1 
 
 
563 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  26.1 
 
 
563 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  26.1 
 
 
548 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  26.3 
 
 
526 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  26.3 
 
 
526 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
420 aa  126  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  26.3 
 
 
526 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  26.3 
 
 
526 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  26.3 
 
 
526 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  25.93 
 
 
549 aa  126  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  25.93 
 
 
549 aa  126  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  25.93 
 
 
549 aa  126  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  25.93 
 
 
549 aa  126  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  25.93 
 
 
549 aa  126  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  25.93 
 
 
549 aa  126  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  25.93 
 
 
549 aa  126  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  25.93 
 
 
549 aa  126  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2049  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 
519 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  25.57 
 
 
526 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.83 
 
 
524 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  26.3 
 
 
526 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 
424 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 
526 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  26.09 
 
 
526 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 
526 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  26.03 
 
 
526 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  30.68 
 
 
436 aa  124  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  28.75 
 
 
526 aa  124  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  25.76 
 
 
526 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  26.68 
 
 
526 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  31.29 
 
 
427 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  25.46 
 
 
832 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  31.49 
 
 
415 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  30.59 
 
 
417 aa  123  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  25.39 
 
 
549 aa  123  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  27.27 
 
 
537 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 
422 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>