More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4495 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
413 aa  796    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  53.38 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  49.76 
 
 
419 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  51.72 
 
 
424 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  51.34 
 
 
411 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  50 
 
 
419 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  51.96 
 
 
424 aa  394  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  51.09 
 
 
411 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  50.61 
 
 
411 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  50.84 
 
 
424 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  51.07 
 
 
424 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  50.6 
 
 
427 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  51.09 
 
 
411 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  50.24 
 
 
421 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  47.23 
 
 
420 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  50.73 
 
 
418 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  50.61 
 
 
418 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  47.42 
 
 
434 aa  358  9e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  50.72 
 
 
423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  49.75 
 
 
422 aa  348  7e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  49.75 
 
 
418 aa  346  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  48.8 
 
 
422 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  47.73 
 
 
427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  45.37 
 
 
418 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  46.68 
 
 
435 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  45.32 
 
 
417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  44.83 
 
 
417 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  43.5 
 
 
427 aa  316  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  44.84 
 
 
417 aa  316  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  46.04 
 
 
420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  42.79 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  43.07 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  48.29 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  45.65 
 
 
417 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  40.54 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  44.74 
 
 
416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  41.79 
 
 
426 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  42.71 
 
 
417 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  42.62 
 
 
427 aa  298  9e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  41.73 
 
 
436 aa  297  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  39.61 
 
 
415 aa  289  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 
428 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 
434 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  43.3 
 
 
434 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.74 
 
 
434 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  42.74 
 
 
434 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  43.02 
 
 
434 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  38.9 
 
 
428 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
389 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  32.84 
 
 
533 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  32.84 
 
 
533 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  36.86 
 
 
531 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 
521 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  32.44 
 
 
397 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  32.44 
 
 
397 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  35.61 
 
 
520 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  32 
 
 
399 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  34.49 
 
 
527 aa  137  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 
517 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  29.26 
 
 
536 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  31.89 
 
 
537 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  34.69 
 
 
547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  32.42 
 
 
812 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 
538 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  31.79 
 
 
538 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  30.81 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 
526 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 
680 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  30.97 
 
 
534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  29.9 
 
 
531 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  29.33 
 
 
526 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 
517 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 
526 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 
682 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 
526 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 
526 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  29.88 
 
 
705 aa  106  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  32.61 
 
 
537 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
526 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  29.01 
 
 
524 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
526 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
526 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.17 
 
 
525 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
526 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
526 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
526 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  31.92 
 
 
526 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
526 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  31.01 
 
 
534 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1871  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  28.23 
 
 
427 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  26.79 
 
 
538 aa  102  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  30.45 
 
 
526 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31.19 
 
 
528 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.65 
 
 
528 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 
521 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  26.88 
 
 
532 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  26.88 
 
 
532 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>