More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1351 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 435 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  46.23 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  45.63 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  44.52 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  45.39 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  46 
 
 		 424 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  46.25 
 
 		 424 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  45.76 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  40.33 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  42.23 
 
 		 419 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  43 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  42.09 
 
 		 418 aa  318  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  46.68 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  41.95 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  44.04 
 
 		 422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  43.41 
 
 		 418 aa  309  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  42.48 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.53 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  40.78 
 
 		 424 aa  305  8.000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  42.86 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  42.62 
 
 		 411 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  42.69 
 
 		 411 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  41.81 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  44.15 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  40.34 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  42.23 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  39.46 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  37.41 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  42.45 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  36.9 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  38.27 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  37.17 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  37.92 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  38.92 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  42.69 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  40.38 
 
 		 417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  39.9 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  40.56 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  40.84 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  37.84 
 
 		 415 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  39.83 
 
 		 427 aa  250  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  37.71 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  37.71 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  37.71 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  36.53 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  36.53 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.6 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  35.49 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  36.82 
 
 		 428 aa  229  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 		 531 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  35.5 
 
 		 521 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  36.31 
 
 		 520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  33.05 
 
 		 533 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  33.05 
 
 		 533 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  34.96 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  32.35 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  34.04 
 
 		 527 aa  144  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  31.59 
 
 		 531 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  33.11 
 
 		 531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 		 680 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  31.32 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  31.53 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  32.26 
 
 		 812 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.43 
 
 		 682 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  32.67 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  31.33 
 
 		 538 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  31.1 
 
 		 517 aa  110  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 705 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  32.09 
 
 		 538 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  32.09 
 
 		 538 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4937  Na+/H+ antiporter  31.99 
 
 		 530 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  31.1 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  32.1 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4485  Na+/H+ antiporter  31.9 
 
 		 534 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0101363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  33.43 
 
 		 526 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.07 
 
 		 528 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  32.86 
 
 		 524 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  30.74 
 
 		 526 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  31.01 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 		 526 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2984  Na+/H+ antiporter  32.05 
 
 		 531 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 527 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  29.11 
 
 		 624 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1871  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  28.49 
 
 		 427 aa  96.7  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 		 526 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 		 526 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2747  Na+/H+ antiporter  30.03 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0311856 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  27.61 
 
 		 525 aa  95.9  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 521 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  32.2 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6528  Na+/H+ antiporter  32.95 
 
 		 527 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  30.46 
 
 		 527 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  30.27 
 
 		 526 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>