More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1377 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1377  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 427 aa  840    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2928  sodium/hydrogen exchanger  69.79 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal  0.659233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  52.1 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2741  sodium/hydrogen exchanger  48.04 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0441  sodium/proton antiporter  49.88 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  48.71 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  48.67 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  49.26 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1058  sodium/hydrogen exchanger  48.14 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.484917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1263  sodium/hydrogen exchanger  47.79 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1296  sodium/hydrogen exchanger  47.79 
 
 		 434 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1219  sodium/hydrogen exchanger  47.55 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3094  sodium/hydrogen exchanger  47.32 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0166581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  47.04 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  46.85 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  47.09 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  42.69 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  42.22 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  39.76 
 
 		 419 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  42.62 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 419 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4847  sodium/hydrogen exchanger  38.44 
 
 		 411 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.108736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  38.54 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5023  sodium/hydrogen exchanger  38.44 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  41.25 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  39.14 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  38.03 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  36.81 
 
 		 420 aa  265  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  38.75 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  40.05 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  39.81 
 
 		 424 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  39.85 
 
 		 421 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  43.09 
 
 		 423 aa  263  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.41 
 
 		 389 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  38.41 
 
 		 416 aa  256  7e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0491  sodium/hydrogen exchanger  38.44 
 
 		 411 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  36.12 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  37.12 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  38.3 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  38.84 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  35.51 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  39.43 
 
 		 422 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  35.83 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  38.31 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  38.82 
 
 		 418 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  37.96 
 
 		 424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  34.35 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1941  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  36.24 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  34.52 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  29.17 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  29.17 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  33.06 
 
 		 705 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  29.23 
 
 		 399 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  29.05 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  28.97 
 
 		 524 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  29.75 
 
 		 521 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  27.94 
 
 		 537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  27.91 
 
 		 536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  29.21 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  29.21 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  27.76 
 
 		 812 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 		 526 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.97 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.97 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  28.85 
 
 		 531 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  30.77 
 
 		 527 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  29.92 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  27.65 
 
 		 682 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 526 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  27.67 
 
 		 534 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  28.76 
 
 		 533 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  30.1 
 
 		 531 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  27.8 
 
 		 526 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 		 680 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 547 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  29.83 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 526 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  27.33 
 
 		 531 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  28.73 
 
 		 537 aa  99.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  27.87 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  28.92 
 
 		 832 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  28.75 
 
 		 534 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6938  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 		 510 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00616672  normal  0.0141453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 538 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  28.69 
 
 		 525 aa  97.4  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 538 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1608  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.01 
 
 		 688 aa  97.4  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  28.94 
 
 		 526 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>