More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0811 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 527 aa  1026    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  61.82 
 
 		 520 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  57.25 
 
 		 521 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  54.27 
 
 		 531 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  38.21 
 
 		 533 aa  239  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  38.21 
 
 		 533 aa  239  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  40.16 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  40.16 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1264  Na+/H+ antiporter  36.2 
 
 		 547 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.380967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1398  sodium/hydrogen exchanger  33.6 
 
 		 517 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1069  Na+/H+ antiporter  34.19 
 
 		 517 aa  190  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 705 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3451  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2665  sodium/hydrogen exchanger  38.71 
 
 		 538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0906  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2626  Na+/H+ antiporter  30.85 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000319507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  35.2 
 
 		 424 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 680 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 682 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  33.47 
 
 		 832 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5307  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 		 513 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.47 
 
 		 537 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  31.87 
 
 		 528 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 532 aa  146  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  34.7 
 
 		 399 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.43 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  34.31 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  29.81 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  27.95 
 
 		 524 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  38.07 
 
 		 725 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 		 524 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.32 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1351  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  34.13 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  29.08 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  29.53 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  34.93 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  34.65 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  29.26 
 
 		 531 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4815  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 		 551 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0871  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 		 511 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0530872  hitchhiker  0.00104579 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  27.66 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  33.74 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  27.17 
 
 		 526 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  26.88 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  29.32 
 
 		 534 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  28.48 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  26.77 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  28.9 
 
 		 527 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6647  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 521 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 		 526 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  32.69 
 
 		 417 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  28.63 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 		 418 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  28.63 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  32.33 
 
 		 832 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 		 832 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  32.67 
 
 		 419 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  28.19 
 
 		 527 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1739  Na+/H+ antiporter  28.93 
 
 		 536 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.190097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  29.3 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5646  Na+/H+ antiporter  29.33 
 
 		 531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  27.24 
 
 		 524 aa  134  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  28.3 
 
 		 527 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  28.66 
 
 		 527 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03713  hypothetical protein  29.32 
 
 		 427 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 		 788 aa  131  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 		 526 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002354  hypothetical protein  29.89 
 
 		 417 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  27.41 
 
 		 528 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  32.39 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0878  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 		 525 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3026  Na+/H+ antiporter  28.17 
 
 		 552 aa  130  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.000850582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  32.15 
 
 		 427 aa  130  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  29.9 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29184  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  27.01 
 
 		 1247 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2108  hypothetical protein  29.77 
 
 		 835 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4534  Na+/H+ antiporter  30.14 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1302  Na+/H+ antiporter  27.77 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.103451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1369  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0185276 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  33.63 
 
 		 417 aa  129  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  27.04 
 
 		 526 aa  128  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6938  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 		 510 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00616672  normal  0.0141453 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  28.5 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5799  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  27.33 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  33.13 
 
 		 418 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  33.03 
 
 		 417 aa  126  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  27.92 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>