More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0298 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  100 
 
 		 505 aa  969    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  51.91 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  53.8 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  54.77 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  54.97 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0163  potassium/proton antiporter  50.76 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  54.91 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  50.76 
 
 		 530 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2947  sodium/hydrogen exchanger  52.89 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0086  sodium/hydrogen exchanger  52.61 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5749  potassium/proton antiporter  49.78 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0152205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3197  potassium/proton antiporter  49.6 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000394197  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3251  sodium/hydrogen exchanger  52.64 
 
 		 503 aa  352  8.999999999999999e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  40.35 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  40.43 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  40.4 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  38.19 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  34.66 
 
 		 485 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  38.49 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  44.95 
 
 		 414 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  31.08 
 
 		 498 aa  249  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  38.05 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  31.22 
 
 		 478 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  35.12 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  40.88 
 
 		 490 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  38.48 
 
 		 486 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  40.44 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  34.23 
 
 		 481 aa  238  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  34.03 
 
 		 445 aa  237  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  38.05 
 
 		 490 aa  236  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  39.6 
 
 		 490 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  35.05 
 
 		 572 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.74 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  35.74 
 
 		 580 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  38.78 
 
 		 605 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  37.3 
 
 		 593 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  35.07 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  36.91 
 
 		 580 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  36.91 
 
 		 580 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  36.31 
 
 		 580 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  37.32 
 
 		 572 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  36.6 
 
 		 598 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  38.41 
 
 		 592 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  35.34 
 
 		 596 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  34.51 
 
 		 581 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  38.01 
 
 		 580 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  35.77 
 
 		 597 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  36.29 
 
 		 580 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  33.82 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  35.26 
 
 		 574 aa  223  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  27.71 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  32.92 
 
 		 506 aa  220  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  37.14 
 
 		 575 aa  220  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  35.91 
 
 		 580 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  38.74 
 
 		 406 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  35.27 
 
 		 580 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  43.13 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  36.14 
 
 		 491 aa  216  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 		 588 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  36.5 
 
 		 597 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  36.6 
 
 		 597 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  37.37 
 
 		 598 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  33.61 
 
 		 576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  33.82 
 
 		 577 aa  213  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  33.4 
 
 		 576 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  33.4 
 
 		 576 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  33.13 
 
 		 576 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  33.4 
 
 		 576 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  33.12 
 
 		 574 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  36.38 
 
 		 597 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  36.79 
 
 		 616 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  36.53 
 
 		 569 aa  209  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  36.38 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  32.02 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  32.02 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  35.58 
 
 		 590 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  32.23 
 
 		 574 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  35.11 
 
 		 596 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0927  sodium/hydrogen exchanger  40.77 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  33.33 
 
 		 574 aa  206  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  35.97 
 
 		 570 aa  206  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  33.86 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  33.96 
 
 		 575 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  33.96 
 
 		 575 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  32.24 
 
 		 496 aa  202  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  32.56 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  32.41 
 
 		 626 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  32.56 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  32.56 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  32.56 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  33.12 
 
 		 573 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  35.22 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  37.35 
 
 		 538 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  32.73 
 
 		 581 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  32.35 
 
 		 577 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  34.36 
 
 		 574 aa  200  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 573 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  35.68 
 
 		 590 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.67 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>