244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2102 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 432 aa  856    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  63.26 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  58.73 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  38.29 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  38.8 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  37.93 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 449 aa  240  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  36.21 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  34.34 
 
 		 453 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  34.75 
 
 		 442 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.57 
 
 		 448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.65 
 
 		 449 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 		 441 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.27 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  31.39 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 		 434 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  32.48 
 
 		 424 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  30.8 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  35.94 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  32.59 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.41 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 		 415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  37.8 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 441 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  33.41 
 
 		 441 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  34.75 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  34.75 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 		 419 aa  190  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.86 
 
 		 439 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  33.63 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.63 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.94 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  34.35 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 439 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 423 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.95 
 
 		 464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  36.54 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  27.1 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  25.24 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  27.09 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  25.77 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.4 
 
 		 498 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  24.52 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.81 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  25.36 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.25 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.23 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 573 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  24.55 
 
 		 608 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  23.64 
 
 		 581 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  24.23 
 
 		 572 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.64 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  22.51 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.31 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  23.91 
 
 		 597 aa  70.1  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  24.31 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  24.72 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.54 
 
 		 597 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  26.67 
 
 		 918 aa  67.4  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  24.87 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  22.22 
 
 		 581 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24.05 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  25.62 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  22.08 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.13 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  23.72 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  27.49 
 
 		 834 aa  63.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  24.23 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  26.08 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  25.08 
 
 		 501 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  21.23 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  24.85 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  22.75 
 
 		 580 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.48 
 
 		 605 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  26.17 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  22.95 
 
 		 610 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  25.31 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  24.53 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  22.53 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  26.23 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  26.23 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.39 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>