More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2613 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 400 aa  765    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  72.12 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  66.12 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  65.84 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  63.33 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  62.06 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  32.56 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  32.43 
 
 		 421 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  33.07 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  32.91 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  27.65 
 
 		 481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  24.01 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  24.63 
 
 		 581 aa  110  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  28.43 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  30.45 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 442 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 608 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  26.35 
 
 		 574 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  26.35 
 
 		 574 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  25.19 
 
 		 574 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  27.71 
 
 		 497 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  26.92 
 
 		 573 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  29.2 
 
 		 486 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  25.12 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  25.12 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  25.12 
 
 		 576 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  25.12 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  27.06 
 
 		 575 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  27.06 
 
 		 575 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  25.37 
 
 		 574 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  26.11 
 
 		 574 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 		 440 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  25.89 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  24.88 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  27.49 
 
 		 580 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  26.08 
 
 		 498 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  25.97 
 
 		 577 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  27.17 
 
 		 572 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  27.86 
 
 		 580 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.85 
 
 		 498 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.86 
 
 		 598 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  28.8 
 
 		 572 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  23.99 
 
 		 477 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 530 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  26.09 
 
 		 485 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  27.75 
 
 		 580 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.33 
 
 		 576 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  26.05 
 
 		 577 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  27.75 
 
 		 580 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  26.05 
 
 		 577 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  27.49 
 
 		 580 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  26.05 
 
 		 577 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  27.49 
 
 		 580 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  26.05 
 
 		 577 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  26.05 
 
 		 577 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  23.57 
 
 		 496 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  24.2 
 
 		 574 aa  90.5  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 498 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 492 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  27.38 
 
 		 582 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  24.41 
 
 		 443 aa  89.7  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  27.7 
 
 		 581 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  27.75 
 
 		 580 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.76 
 
 		 483 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  27.41 
 
 		 570 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  26.86 
 
 		 578 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  28.92 
 
 		 598 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.47 
 
 		 580 aa  86.7  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  28.85 
 
 		 490 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  31.06 
 
 		 423 aa  86.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  23.04 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.57 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  27.98 
 
 		 597 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 		 573 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  24.76 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  26.61 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>