86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2477 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 457 aa  872    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  40.7 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  40.44 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  27.39 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  30.14 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  29.04 
 
 		 435 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  30.84 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.73 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  32.85 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  29.18 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  27.76 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  27.53 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  26.29 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 		 573 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  29.5 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.18 
 
 		 597 aa  56.6  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  28.13 
 
 		 623 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 588 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  28.45 
 
 		 530 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  23.45 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 		 570 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  32.73 
 
 		 590 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  24.34 
 
 		 415 aa  50.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.9 
 
 		 581 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.29 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  24.93 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  28.16 
 
 		 616 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  27.24 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 577 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  23.92 
 
 		 626 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.95 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  33.33 
 
 		 580 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 577 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 		 609 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 574 aa  47.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.12 
 
 		 598 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  32.68 
 
 		 590 aa  47  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 		 527 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.26 
 
 		 690 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  32.87 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.12 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  31.65 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  26.19 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  30.19 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.65 
 
 		 596 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  26.08 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  26.81 
 
 		 597 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  30 
 
 		 527 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 		 604 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.16 
 
 		 608 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 		 572 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  29.02 
 
 		 499 aa  43.5  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  31.47 
 
 		 576 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  24.76 
 
 		 410 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  31.08 
 
 		 524 aa  43.5  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  25.34 
 
 		 538 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0497  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.85 
 
 		 695 aa  43.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.429815  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  31.52 
 
 		 596 aa  43.1  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  25.29 
 
 		 443 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>