277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3070 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 436 aa  842    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  44.82 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  40.83 
 
 		 421 aa  256  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  42.05 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  41.58 
 
 		 435 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  77.42 
 
 		 173 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  39.15 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  38.25 
 
 		 440 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  36.55 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  29.28 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 		 400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  32.3 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  25.77 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 608 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  24.02 
 
 		 413 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  28.38 
 
 		 597 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.2 
 
 		 580 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 491 aa  86.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  24.89 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  28.5 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  25.29 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  27.52 
 
 		 918 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  27.37 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.07 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.48 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  29.05 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  25.12 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  26.52 
 
 		 581 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  24.66 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.04 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.48 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  26.71 
 
 		 574 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  28 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  26.94 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  26.63 
 
 		 605 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  23.92 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  26.01 
 
 		 576 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.72 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.29 
 
 		 598 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  26.67 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  29.66 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  27.57 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.75 
 
 		 596 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  29.18 
 
 		 616 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 		 572 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  27.8 
 
 		 498 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.38 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  23.49 
 
 		 612 aa  66.6  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  27.38 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  24.25 
 
 		 834 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  28.14 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  28.14 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  27.15 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 		 588 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  30.22 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  26.93 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  25.67 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  33.55 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  30.22 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  25.28 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.14 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.62 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  26.52 
 
 		 580 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  25.41 
 
 		 610 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>