224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2072 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 449 aa  867    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  64.24 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  55.42 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  54.63 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  47.4 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  47.95 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  47.86 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  44.08 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  43.85 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  49.32 
 
 		 444 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  43.27 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  43.5 
 
 		 441 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  43.37 
 
 		 413 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  43.37 
 
 		 413 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  43.44 
 
 		 440 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  43.44 
 
 		 440 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  43.44 
 
 		 440 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  45.8 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  45.8 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  45.8 
 
 		 439 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  42.48 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  39.55 
 
 		 464 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.45 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  40.13 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.78 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  41.18 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  36.36 
 
 		 413 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  38.83 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  40.94 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 432 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 415 aa  199  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30.93 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  36.78 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  33.49 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  34.99 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  35.26 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 		 423 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.67 
 
 		 413 aa  100  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  36.73 
 
 		 425 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  27.83 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  26.86 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  27.45 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  25.92 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  27.87 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  25.41 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  27.05 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  28.15 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  31.16 
 
 		 834 aa  73.6  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.77 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.94 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.65 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  29.29 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  25.29 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  30.13 
 
 		 918 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.18 
 
 		 597 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  28.07 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.86 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  25.94 
 
 		 610 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  28.88 
 
 		 576 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  36.76 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  25.17 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  25.81 
 
 		 624 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.06 
 
 		 598 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  26.07 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  27.12 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  25.44 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  25.35 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  27.13 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.43 
 
 		 598 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  22.99 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3954  Sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  25.24 
 
 		 577 aa  59.7  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  36.17 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  23.56 
 
 		 481 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  25.6 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  29.67 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  29.75 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>