70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1375 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 403 aa  769    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  41.98 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  40.7 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 421 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  29.28 
 
 		 436 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  30.73 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 393 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  26.54 
 
 		 413 aa  96.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.2 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  22.86 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  25.35 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  25.71 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  25.84 
 
 		 918 aa  60.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  27.43 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  27.24 
 
 		 580 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  23.62 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  22.53 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.69 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  19.7 
 
 		 527 aa  55.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  24.89 
 
 		 538 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  22.99 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  22.46 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 588 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  23.39 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  23.81 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  26.03 
 
 		 590 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  21.74 
 
 		 173 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  25.17 
 
 		 590 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  27.76 
 
 		 581 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  24.43 
 
 		 509 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  26.62 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  24.86 
 
 		 486 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.19 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.02 
 
 		 578 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  29.88 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  25.58 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.55 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  26.77 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  26.44 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  28.66 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  24.36 
 
 		 608 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  33.33 
 
 		 498 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  24.01 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  25.67 
 
 		 596 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  24.01 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  25.56 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>