138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1460 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 430 aa  833    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  64.78 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  44.71 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  42.17 
 
 		 421 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  40.85 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  38.13 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  36.55 
 
 		 413 aa  196  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  38.9 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  39.95 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  29.62 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  42.58 
 
 		 173 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  31.09 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  31.45 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  26.2 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  30.85 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  29.28 
 
 		 597 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.47 
 
 		 596 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  28.24 
 
 		 598 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  25.98 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.38 
 
 		 597 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.42 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  26.08 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  29.25 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.3 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  26.46 
 
 		 918 aa  63.9  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 		 608 aa  63.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.59 
 
 		 597 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.64 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  26.57 
 
 		 580 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  29.46 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.08 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.37 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  28.52 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  31.14 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  24.58 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05035  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.79 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  32.85 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  25.79 
 
 		 834 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.86 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  26.69 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  25.84 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 		 588 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 442 aa  57  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  27.9 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 		 572 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  27.96 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  25.26 
 
 		 605 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 530 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 		 667 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0329  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.69 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  27.23 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  27.62 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  28.52 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04131  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.56 
 
 		 698 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966823  normal  0.103258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  35.11 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  29.17 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  25.6 
 
 		 527 aa  52.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 597 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 692 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  25.71 
 
 		 590 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 692 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  21.41 
 
 		 478 aa  51.2  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  27.24 
 
 		 597 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  30.89 
 
 		 535 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  25.81 
 
 		 605 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  26.6 
 
 		 581 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  27.13 
 
 		 553 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  26.71 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.16 
 
 		 598 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>