127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0172 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  100 
 
 		 464 aa  908    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  46.15 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  46.64 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 		 444 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  47.29 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  47.29 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  45.29 
 
 		 441 aa  326  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  46.3 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  45.83 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  47.7 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  47.7 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  47.47 
 
 		 440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  44.24 
 
 		 451 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  46.79 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  46.12 
 
 		 439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  46.12 
 
 		 439 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  46.12 
 
 		 439 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  40.37 
 
 		 449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  38.76 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  41.19 
 
 		 445 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  39.59 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  35.52 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  33.84 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.8 
 
 		 448 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  33.33 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.33 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  31.74 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 413 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 432 aa  170  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 424 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  30 
 
 		 415 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 		 410 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  30.28 
 
 		 424 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  31.39 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  31.22 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  30.27 
 
 		 421 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  24.43 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.47 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  27.46 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  26.71 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  35.4 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  32.16 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  26.96 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  25.28 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  27.23 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  25.86 
 
 		 487 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.56 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  26.51 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  27.83 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  22.61 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  31.13 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  26.32 
 
 		 596 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  22.19 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  27.39 
 
 		 605 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  25.98 
 
 		 597 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  23.7 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 		 533 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  31.18 
 
 		 533 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  24.52 
 
 		 393 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  26.61 
 
 		 918 aa  53.5  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.15 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  24.88 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.35 
 
 		 597 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  25.42 
 
 		 573 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  25.98 
 
 		 597 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  23.76 
 
 		 598 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  23.79 
 
 		 616 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  20.26 
 
 		 445 aa  50.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  29.03 
 
 		 413 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  27.49 
 
 		 834 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  23.6 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  28.21 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  23.27 
 
 		 597 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  26.11 
 
 		 505 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  28.42 
 
 		 547 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.2 
 
 		 1050 aa  47.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1985  sodium/hydrogen exchanger  24.26 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  32.59 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  17.56 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  21.94 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.6 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  26.6 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  24.56 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>