204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0349 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 443 aa  864    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  75.63 
 
 		 448 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  55.13 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  55.16 
 
 		 445 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  47.26 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  44.93 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  44.93 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  42.98 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  44.6 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  44.18 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  44.18 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  44.24 
 
 		 444 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  45.41 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  45.41 
 
 		 441 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  40.77 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.72 
 
 		 448 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  39.2 
 
 		 432 aa  273  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  40.48 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  45.17 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  44.59 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  44.59 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.59 
 
 		 449 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  39.02 
 
 		 464 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  40.31 
 
 		 454 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  44.9 
 
 		 439 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.9 
 
 		 439 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.9 
 
 		 439 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  43.21 
 
 		 439 aa  255  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  39.82 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  35.29 
 
 		 413 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.48 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 		 419 aa  211  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  39.02 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  33.19 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  35.65 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  34.17 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  35.25 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  34.4 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 425 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 		 498 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  39.19 
 
 		 460 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  38.41 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  39.19 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.57 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.8 
 
 		 597 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  29.08 
 
 		 918 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  24.83 
 
 		 596 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24.68 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  36.97 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  28.13 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  26.41 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  24.18 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  26.83 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.06 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.27 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  28.32 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  21.43 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  24.4 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  24.75 
 
 		 626 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  24 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  24.36 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  24.57 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  26.68 
 
 		 741 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  24.61 
 
 		 597 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  28.11 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  23.41 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  30.12 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07250  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  26.54 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  23.78 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  24.44 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  27.86 
 
 		 486 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  23.21 
 
 		 486 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.23 
 
 		 505 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  25 
 
 		 834 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  24.48 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  24.48 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  24.48 
 
 		 597 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  23.26 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  27.17 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  26.28 
 
 		 597 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>