169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5291 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
444 aa  866    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  72.91 
 
 
451 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  71.43 
 
 
441 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  64.41 
 
 
440 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  64.19 
 
 
440 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  64.19 
 
 
440 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  62.39 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  66.67 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  62.16 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  66.67 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  66.67 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  62.87 
 
 
439 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  55.04 
 
 
429 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  54.76 
 
 
429 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  54.5 
 
 
413 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  54.5 
 
 
413 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  46.24 
 
 
464 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  49.32 
 
 
449 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  47.36 
 
 
445 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  44.7 
 
 
443 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  46.03 
 
 
448 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  36.43 
 
 
442 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  36.47 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.18 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  35.98 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.76 
 
 
449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  34.37 
 
 
413 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  37.91 
 
 
454 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  33.11 
 
 
432 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  37.58 
 
 
454 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  31.15 
 
 
424 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  35.58 
 
 
425 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  29.64 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 
415 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 
419 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 
410 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  35.33 
 
 
424 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 
421 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  27.77 
 
 
437 aa  136  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  32.9 
 
 
423 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 
423 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 
460 aa  106  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
400 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 
425 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 
421 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  42.41 
 
 
408 aa  96.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  26.64 
 
 
436 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  30.19 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  27.03 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.65 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  26.68 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  27.01 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  25.99 
 
 
486 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  25.98 
 
 
485 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  25.54 
 
 
741 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  20.92 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.83 
 
 
597 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 
393 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.72 
 
 
505 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  24.81 
 
 
596 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 
487 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 
406 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.07 
 
 
597 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
491 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3251  sodium/hydrogen exchanger  30.46 
 
 
503 aa  56.6  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  21.01 
 
 
527 aa  56.2  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  22.47 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  26.19 
 
 
607 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  24.61 
 
 
598 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  23.19 
 
 
406 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.07 
 
 
608 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  27.53 
 
 
918 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 
601 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  22.47 
 
 
481 aa  54.7  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 
420 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  26.25 
 
 
834 aa  53.9  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 
417 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  30.4 
 
 
501 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  26.54 
 
 
500 aa  53.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2356  sodium/hydrogen exchanger  37.33 
 
 
410 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314929  decreased coverage  0.000354655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  24.55 
 
 
763 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 
604 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  29.24 
 
 
497 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  26.33 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 
617 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.19 
 
 
592 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  34.87 
 
 
547 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  25.26 
 
 
506 aa  50.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  32.14 
 
 
430 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  26.81 
 
 
393 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.382346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>