177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1264 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1264  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
425 aa  820    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307266  hitchhiker  0.00798224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3355  sodium/hydrogen exchanger  54.74 
 
 
424 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  53.06 
 
 
424 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  54.05 
 
 
421 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  48.66 
 
 
419 aa  339  5e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  44.77 
 
 
415 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  44.23 
 
 
415 aa  323  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  47.42 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4010  sodium/hydrogen exchanger  49.05 
 
 
423 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0600  sodium/hydrogen exchanger  49.38 
 
 
434 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  45.63 
 
 
410 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  45.77 
 
 
437 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6115  sodium/hydrogen exchanger  48.89 
 
 
424 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 
432 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  37.14 
 
 
420 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3759  sodium/hydrogen exchanger  42.19 
 
 
425 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  35.49 
 
 
413 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  38.93 
 
 
443 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  36.08 
 
 
449 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4288  sodium/hydrogen exchanger  38.23 
 
 
448 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  35.33 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  38.01 
 
 
445 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.2 
 
 
451 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.55 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  33.56 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.79 
 
 
448 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2693  Sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 
453 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722411 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  34.99 
 
 
441 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  34.54 
 
 
441 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  33.91 
 
 
444 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
413 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
413 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6074  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 
440 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0981036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1345  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6484  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3176  putative transporter  33.33 
 
 
454 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.830167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36960  putative transporter  33.62 
 
 
454 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.625035  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1334  Na+/H+ antiporter-like protein  33.03 
 
 
439 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3111  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.03 
 
 
439 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2986  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.03 
 
 
439 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5477  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 
439 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437276 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0172  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  32.29 
 
 
464 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  28.81 
 
 
410 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 
435 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  30.13 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  29.39 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  28.35 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  22.26 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  27.69 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  29.64 
 
 
487 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1002  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.89 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  28.48 
 
 
572 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  27.38 
 
 
486 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  24.02 
 
 
498 aa  64.7  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  25.68 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 
530 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.04 
 
 
496 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05187  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  23.96 
 
 
605 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0313357  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.3 
 
 
597 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  26.07 
 
 
440 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 
491 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  25.59 
 
 
406 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 
596 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  26.47 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.88 
 
 
596 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  27.88 
 
 
596 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.88 
 
 
596 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  27.03 
 
 
580 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.88 
 
 
596 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  29.21 
 
 
497 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.88 
 
 
596 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.85 
 
 
598 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83480  Na+/H+ antiporter  22.98 
 
 
834 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.932165  normal  0.265133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  25.41 
 
 
608 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.88 
 
 
596 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2753  Sodium/hydrogen exchanger  24.25 
 
 
442 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.36705  normal  0.499741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  26.09 
 
 
626 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  27.83 
 
 
509 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4485  Na+/H+ antiporter  31.66 
 
 
534 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0101363 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 
499 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  28.34 
 
 
597 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  29.07 
 
 
610 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  23.75 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  29.2 
 
 
580 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  29.94 
 
 
597 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  24.38 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  27.68 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>