287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2449 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 393 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  50.38 
 
 		 440 aa  311  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  41.31 
 
 		 421 aa  252  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  45.13 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  41.32 
 
 		 435 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  36.76 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  39.22 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  30.73 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  31.64 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 		 460 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  32.12 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  31.94 
 
 		 412 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4701  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  33.97 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  29.51 
 
 		 429 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  27.67 
 
 		 626 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  29.36 
 
 		 597 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4634  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4930  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4547  sodium/hydrogen exchanger  30.1 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  27.9 
 
 		 576 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  31.42 
 
 		 616 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5448  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 441 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.963014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 		 574 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  28.45 
 
 		 572 aa  90.1  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  27.55 
 
 		 596 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  28.18 
 
 		 576 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  28.18 
 
 		 576 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  28.18 
 
 		 576 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  28.18 
 
 		 576 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  25.34 
 
 		 413 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  27.22 
 
 		 581 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 605 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  27.99 
 
 		 624 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  25.56 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  27.9 
 
 		 574 aa  86.3  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3078  Na(+)/H(+) antiporter  36.31 
 
 		 173 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00966198  normal  0.34465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  27.53 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  24.94 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  25.07 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  27.91 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  26.04 
 
 		 597 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 588 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  27.64 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0638  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  27.18 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  27.5 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  27.67 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  28.14 
 
 		 597 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  30.58 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  25.34 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  27.43 
 
 		 597 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  26.7 
 
 		 597 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  31.59 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.57 
 
 		 598 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  28.57 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  27.67 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  27.67 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  28.06 
 
 		 608 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1158  CPA1 family Na+/H+ antiporter  27.93 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801861  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  27.12 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  30.03 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  28.91 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  25.55 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  25.55 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  25.55 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  25.55 
 
 		 577 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  25.55 
 
 		 577 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  26.35 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  24.66 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 		 610 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  27.27 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  25.35 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1844  sodium/hydrogen exchanger  27.78 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  29.19 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  27.65 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2477  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  27.78 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6339  sodium/hydrogen exchanger  29.33 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.096144 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5609  sodium/hydrogen exchanger  29.33 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.872686 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01890  Na+/H+ exchanger AnNHA1, putative  25.31 
 
 		 918 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  24.43 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  25.82 
 
 		 597 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1955  sodium/hydrogen exchanger  27.88 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.659696  normal  0.571935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>