More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3170 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3170  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 396 aa  776    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4227  sodium/hydrogen exchanger  69.19 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  66.23 
 
 		 402 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1109  sodium/hydrogen exchanger  66.49 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  34.25 
 
 		 506 aa  219  7e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  37.5 
 
 		 597 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  35.28 
 
 		 478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  38.4 
 
 		 598 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  38.32 
 
 		 497 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  36.27 
 
 		 509 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  36.79 
 
 		 597 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  37.63 
 
 		 575 aa  204  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  35.6 
 
 		 477 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  36.41 
 
 		 598 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 		 574 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  35.79 
 
 		 485 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  37.9 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  33.16 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  32.8 
 
 		 486 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.8 
 
 		 578 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  38.97 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 		 588 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  37.05 
 
 		 596 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 573 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  36.03 
 
 		 580 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  37.5 
 
 		 572 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.03 
 
 		 598 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  35.68 
 
 		 577 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  35.24 
 
 		 580 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  33.76 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  34.49 
 
 		 581 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  33.93 
 
 		 481 aa  189  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  35.55 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  36.96 
 
 		 577 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  34.73 
 
 		 576 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  36.1 
 
 		 485 aa  189  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  36.48 
 
 		 580 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  33.76 
 
 		 527 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  34.6 
 
 		 626 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  36.68 
 
 		 577 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  36.68 
 
 		 577 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  36.68 
 
 		 577 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  36.68 
 
 		 577 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  36.06 
 
 		 597 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  36.41 
 
 		 574 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  36.41 
 
 		 574 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  36.41 
 
 		 574 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  36.75 
 
 		 580 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  37.11 
 
 		 597 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  35.66 
 
 		 597 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  35.7 
 
 		 573 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 		 605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  34.41 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  34.3 
 
 		 576 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  34.3 
 
 		 576 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  34.3 
 
 		 576 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  34.3 
 
 		 576 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  36.18 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  35.56 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 		 608 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  35.7 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  35.7 
 
 		 575 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  36.15 
 
 		 574 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  33.33 
 
 		 581 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  36 
 
 		 572 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  35.7 
 
 		 580 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  35.7 
 
 		 580 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  35.16 
 
 		 582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  35.36 
 
 		 574 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  34.74 
 
 		 580 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  35 
 
 		 580 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  35.48 
 
 		 499 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  37.09 
 
 		 578 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  37.09 
 
 		 578 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  37.09 
 
 		 578 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  37.09 
 
 		 578 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  34.35 
 
 		 597 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  35.36 
 
 		 574 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  36.09 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  36.09 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  36.09 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  36.09 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  36.09 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  35.7 
 
 		 581 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  33.6 
 
 		 531 aa  173  5.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  36.52 
 
 		 570 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66380  potassium/proton antiporter  36.02 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  34.18 
 
 		 596 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1930  potassium/proton antiporter  35.21 
 
 		 569 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401785  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 		 496 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  34.96 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0915  sodium/hydrogen exchanger  37.07 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101671  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  34.02 
 
 		 590 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 		 490 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0870  Sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1171  sodium/hydrogen exchanger  36.6 
 
 		 490 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.246697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  36.14 
 
 		 498 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>