273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3909 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  64.27 
 
 		 569 aa  743    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 607 aa  1217    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  54.76 
 
 		 637 aa  636    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  69.8 
 
 		 619 aa  859    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  54.82 
 
 		 669 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  52.26 
 
 		 622 aa  622  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  55.34 
 
 		 670 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  54.82 
 
 		 673 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  54.82 
 
 		 670 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  55.77 
 
 		 719 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  52.87 
 
 		 616 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  54.14 
 
 		 666 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  51.25 
 
 		 651 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  52.88 
 
 		 643 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  54.03 
 
 		 660 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  54.03 
 
 		 660 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  53.86 
 
 		 660 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  54.03 
 
 		 660 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  53.61 
 
 		 625 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  54.38 
 
 		 702 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  50.92 
 
 		 611 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  50.75 
 
 		 611 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  50.51 
 
 		 608 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  50.51 
 
 		 601 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  50.76 
 
 		 602 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  49.66 
 
 		 599 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  46.62 
 
 		 597 aa  549  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  49.23 
 
 		 602 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  49.49 
 
 		 601 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  49.16 
 
 		 601 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  45.27 
 
 		 599 aa  535  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  46.4 
 
 		 598 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  46.09 
 
 		 611 aa  485  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  41.05 
 
 		 760 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  43.48 
 
 		 617 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  40.73 
 
 		 763 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  41.07 
 
 		 764 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  43.11 
 
 		 616 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  41.98 
 
 		 852 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  36.27 
 
 		 604 aa  362  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 596 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.42 
 
 		 596 aa  319  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.35 
 
 		 596 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.35 
 
 		 596 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.35 
 
 		 596 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  33.97 
 
 		 606 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  34.35 
 
 		 596 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.42 
 
 		 596 aa  317  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  35.51 
 
 		 640 aa  306  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 		 623 aa  303  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  35.1 
 
 		 625 aa  301  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  36.3 
 
 		 584 aa  280  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  35.41 
 
 		 741 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  33.14 
 
 		 641 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  32.58 
 
 		 607 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  31.83 
 
 		 640 aa  247  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  34.41 
 
 		 652 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  34.41 
 
 		 652 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 660 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  30.98 
 
 		 629 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  33.19 
 
 		 628 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  31.49 
 
 		 639 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 		 609 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  33.26 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 		 637 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  33.55 
 
 		 612 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  32.77 
 
 		 617 aa  210  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  33 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  29.02 
 
 		 595 aa  204  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  37.22 
 
 		 593 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  37.85 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.12 
 
 		 617 aa  191  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.55 
 
 		 630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.82 
 
 		 626 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.39 
 
 		 628 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  35.75 
 
 		 421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.22 
 
 		 399 aa  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.56 
 
 		 402 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.92 
 
 		 399 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 		 401 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.46 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.81 
 
 		 414 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.81 
 
 		 414 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.3 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  29.44 
 
 		 596 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  28.91 
 
 		 597 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  30.16 
 
 		 597 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  28.9 
 
 		 598 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  29.47 
 
 		 597 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  29.22 
 
 		 597 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 574 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  27.46 
 
 		 597 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.68 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 588 aa  97.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  25.57 
 
 		 445 aa  97.1  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0550  sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  25.87 
 
 		 605 aa  96.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  27.81 
 
 		 431 aa  96.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  29.91 
 
 		 483 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>